RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264346.11

HERC6-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC6, Length 3,779 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6-201ENST00000264346 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 WASF1Q92558 559 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 AIFM3Q96NN9 605 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.51□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 PTPN14Q15678 1187 aa14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 SETDB2Q96T68 719 aa14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 PXDNQ92626 1479 aa14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 PDE6AP16499 860 aa14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 NLRP5P59047 1200 aa14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.5□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 C6orf229H3BNL8 230 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 SKILP12757 684 aa14.49□□□□□ -0.09
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HERC6-201ENST00000264346 NLRP3Q96P20 1036 aa14.49□□□□□ -0.09
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HERC6-201ENST00000264346 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 F8W031 263 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 NLRP10Q86W26 655 aa14.49□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 DYNC1I1O14576 645 aa14.48□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 LPIN2Q92539 896 aa14.48□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.48□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 SMTNL1A8MU46 457 aa14.48□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 GNPATO15228 680 aa14.48□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 IFNKQ9P0W0 207 aa14.48□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 PRKAB2O43741 272 aa14.48□□□□□ -0.09
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HERC6-201ENST00000264346 RFC4P35249 363 aa14.48□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.48□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.48□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 PFKFB2O60825 505 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 STX17P56962 302 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 FOXO4P98177 505 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 ESR2Q92731 530 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 PTPN21Q16825 1174 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 KRT40Q6A162 431 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 KRT23Q9C075 422 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 TXLNAP40222 546 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 CABP5Q9NP86 173 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 HS1BP3Q53T59 392 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 ANO1Q5XXA6 986 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 DHX58Q96C10 678 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 ATG3Q9NT62 314 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 CLIC4Q9Y696 253 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
HERC6-201ENST00000264346 MCAMP43121 646 aa14.46□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 STAMQ92783 540 aa14.46□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.46□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 PLIN2Q99541 437 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 UBASH3AP57075 661 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 CLIC6Q96NY7 704 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 SIK1P57059 783 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 ZNF202O95125 648 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC6-201ENST00000264346 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
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