RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060125.6

Scn4b-201, Transcript of Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scn4b, Length 4,982 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Apbb1ipQ8R5A3 670 aa15.63■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 ChmQ9QXG2 665 aa15.63■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sun3Q5SS91 320 aa15.62■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 PzpQ61838 1495 aa15.62■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Samd15F6XZJ7 620 aa15.62■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 SsbP32067 415 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Surf6P70279 355 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Col17a1Q07563 1470 aa15.62■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 PtprtQ99M80 1454 aa15.62■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rims1Q99NE5 1463 aa15.62■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Usp35M0QWN7 1009 aa15.62■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Senp1P59110 640 aa15.62■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cracr2aQ3UP38 310 aa15.62■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Q8BZJ8 459 aa15.62■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dact3Q0PHV7 610 aa15.62■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa15.62■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Aox1O54754 1333 aa15.61■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nedd9O35177 833 aa15.61■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dync1i2O88487 612 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ppp1r7Q3UM45 361 aa15.61■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 GpkowQ56A08 488 aa15.61■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 BrapQ99MP8 591 aa15.61■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tsnaxip1Q99P25 704 aa15.61■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa15.61■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm10563F6WIE4 79 aa15.61■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa15.61■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cct6bQ61390 531 aa15.61■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slc12a5Q91V14 1138 aa15.61■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Spats2lQ91WJ7 558 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Haus2Q9CQS9 234 aa15.61■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 VeztQ3ZK22 780 aa15.6■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 IqceQ6PCQ0 778 aa15.6■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tsr2Q8C8T8 191 aa15.6■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cdan1Q8CC12 1239 aa15.6■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Aldh1l2Q8K009 923 aa15.6■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa15.6■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zbtb21E9Q444 1094 aa15.6■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 ByslO54825 436 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 RcvrnP34057 202 aa15.6■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 HhatQ8BMT9 499 aa15.6■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cgref1Q8R1U2 281 aa15.6■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zranb3Q6NZP1 1069 aa15.6■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 AU019823E9PUQ3 292 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmed1Q3V009 227 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 RilpQ5ND29 369 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Vps37dQ810I0 261 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hgh1Q8C3I8 393 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tceanc2Q8R2M0 207 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pet2A2AHY8 747 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nlrp4cQ3TKR3 982 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hirip3Q8BLH7 601 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tacc2Q9JJG0 1149 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Myo1cQ9WTI7 1063 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tulp4Q9JIL5 1547 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Atp2a2O55143 1044 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ercc5P35689 1170 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Speer4dL7N216 212 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Wdr44Q6NVE8 915 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Lrrc8aQ80WG5 810 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa15.59■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dab2P98078 766 aa15.58■□□□□ 0.09
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm15262A0A140LIQ5 728 aa15.58■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Atp8b2P98199 1209 aa15.58■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rnf168Q80XJ2 565 aa15.58■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nup133Q8R0G9 1155 aa15.58■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Bag2Q91YN9 210 aa15.58■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Stag1Q9D3E6 1258 aa15.58■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nop56Q9D6Z1 580 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rnf40Q3U319 1001 aa15.58■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Klc4Q9DBS5 619 aa15.58■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Setd1aE9PYH6 1716 aa15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pde11aP0C1Q2 933 aa15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gtpbp10Q8K013 366 aa15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Efhd1Q9D4J1 240 aa15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 AatfQ9JKX4 526 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Angptl3Q9R182 455 aa15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fchsd1Q6PFY1 688 aa15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Krit1Q6S5J6 736 aa15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 RestQ8VIG1 1082 aa15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Card14Q99KF0 999 aa15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mcmdc2E9Q956 681 aa15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc82Q6PG04 518 aa15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Efcab14Q8BGQ6 484 aa15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mterf4Q8BVN4 346 aa15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Vps52Q8C754 723 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hdac9Q99N13 588 aa15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sar1bQ9CQC9 198 aa15.57■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 1700006A11RikB9EHI3 544 aa15.56■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Caprin2Q05A80 1031 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Myo6Q64331 1265 aa15.56■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zscan22Q8BGS5 496 aa15.56■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cfap57Q9D180 1249 aa15.56■□□□□ 0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc97Q9DBT3 340 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 58.7 ms