Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ChmQ9QXG2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
ChmQ9QXG2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ChmQ9QXG2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
ChmQ9QXG2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ChmQ9QXG2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ChmQ9QXG2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ChmQ9QXG2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ChmQ9QXG2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ChmQ9QXG2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ChmQ9QXG2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ChmQ9QXG2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ChmQ9QXG2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ChmQ9QXG2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ChmQ9QXG2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ChmQ9QXG2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ChmQ9QXG2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ChmQ9QXG2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ChmQ9QXG2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ChmQ9QXG2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ChmQ9QXG2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ChmQ9QXG2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ChmQ9QXG2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ChmQ9QXG2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ChmQ9QXG2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
ChmQ9QXG2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ChmQ9QXG2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ChmQ9QXG2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ChmQ9QXG2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
ChmQ9QXG2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ChmQ9QXG2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ChmQ9QXG2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
ChmQ9QXG2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
ChmQ9QXG2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ChmQ9QXG2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ChmQ9QXG2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ChmQ9QXG2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ChmQ9QXG2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
ChmQ9QXG2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ChmQ9QXG2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
ChmQ9QXG2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ChmQ9QXG2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
ChmQ9QXG2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
ChmQ9QXG2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ChmQ9QXG2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ChmQ9QXG2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ChmQ9QXG2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ChmQ9QXG2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ChmQ9QXG2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ChmQ9QXG2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ChmQ9QXG2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ChmQ9QXG2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ChmQ9QXG2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ChmQ9QXG2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ChmQ9QXG2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ChmQ9QXG2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ChmQ9QXG2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ChmQ9QXG2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ChmQ9QXG2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ChmQ9QXG2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ChmQ9QXG2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ChmQ9QXG2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ChmQ9QXG2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ChmQ9QXG2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ChmQ9QXG2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ChmQ9QXG2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ChmQ9QXG2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ChmQ9QXG2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ChmQ9QXG2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ChmQ9QXG2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ChmQ9QXG2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ChmQ9QXG2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ChmQ9QXG2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ChmQ9QXG2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ChmQ9QXG2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ChmQ9QXG2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ChmQ9QXG2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ChmQ9QXG2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ChmQ9QXG2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ChmQ9QXG2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ChmQ9QXG2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ChmQ9QXG2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ChmQ9QXG2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ChmQ9QXG2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ChmQ9QXG2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ChmQ9QXG2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ChmQ9QXG2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ChmQ9QXG2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ChmQ9QXG2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ChmQ9QXG2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ChmQ9QXG2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ChmQ9QXG2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ChmQ9QXG2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ChmQ9QXG2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ChmQ9QXG2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ChmQ9QXG2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ChmQ9QXG2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ChmQ9QXG2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ChmQ9QXG2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ChmQ9QXG2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms