RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trim47	Q8C0E3	641 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cdan1	Q8CC12	1239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc38	Q8CDN8	563 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ints11	Q9CWS4	600 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rrp15	Q9CYX7	281 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smim23	Q9DAL0	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tor1b	Q9ER41	336 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gtf2ird1	Q9JI57	1104 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Plcb1	Q9Z1B3	1216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Map7d2	A2AG50	781 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Obp2b	A2BHR0	176 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nedd1	P33215	660 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gpr3	P35413	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kcnn2	P58390	839 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cgn	P59242	1191 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gabpb2	P81069	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gja5	Q01231	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mtf2	Q02395	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fscn2	Q32M02	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Iqsec3	Q3TES0	1195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc10a7	Q5PT53	340 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	BC061237	Q6P8I2	184 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Podn	Q7TQ62	611 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppp1r15b	Q8BFW3	697 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wdr35	Q8BND3	1181 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gk5	Q8BX05	534 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nupl2	Q8CIC2	420 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rtn1	Q8K0T0	780 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Snapc2	Q91XA5	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Anapc16	Q9CPV2	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tex21	Q9R0U9	575 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kif15	Q6P9L6	1387 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prdm2	A2A7B5	1709 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cspp1	B2RX88	1205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppargc1a	O70343	797 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aff3	P51827	1254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smad5	P97454	465 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Skap2	Q3UND0	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pnma5	Q5DTT8	618 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Klra8	Q60682	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbc1d1	Q60949	1255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Madcam1	Q61826	405 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcdhga7	Q6DD96	935 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krt77	Q6IFZ6	572 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cypt2	Q6P924	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kctd12	Q6WVG3	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tacc1	Q6Y685	774 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Plekhm2	Q80TQ5	1018 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gtf2a2	Q80ZM7	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fut11	Q8BHC9	489 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Samd14	Q8K070	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kbtbd4	Q8R179	534 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mxra7	Q9CZH7	178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Erich6b	Q9D4S6	220 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vti1b	O88384	232 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cast	P51125	788 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	A1bg	Q19LI2	512 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ube2q1	Q7TSS2	422 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Whrn	Q80VW5	918 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gjd4	Q8BSD4	364 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smc5	Q8CG46	1101 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trappc12	Q8K2L8	797 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tkfc	Q8VC30	578 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppil4	Q9CXG3	492 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam83d	Q9D7I8	585 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rabgef1	Q9JM13	491 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Orc1	Q9Z1N2	840 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm29133	A0A1B0GT72	266 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm12666	A2AMD0	254 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ddx23	D3Z0M9	819 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Agr2	O88312	175 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Magea5	O89009	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pde4a	O89084	844 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pde6b	P23440	856 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prkar2b	P31324	416 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Senp1	P59110	640 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bach2	P97303	839 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Brd9	Q3UQU0	596 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem40	Q4FJU9	225 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Abhd15	Q5F2F2	459 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbx2	Q60707	711 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Picalm	Q7M6Y3	660 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf423	Q80TS5	1292 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pip4k2b	Q80XI4	416 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tor4a	Q8BH02	426 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc7a4	Q8BLQ7	635 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Col26a1	Q91VF6	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	St7	Q99M96	577 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aasdhppt	Q9CQF6	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cfap53	Q9D439	514 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pin1	Q9QUR7	165 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kif21a	Q9QXL2	1672 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kcnh4	A2A5F7	1018 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slfn8	B1ARD8	910 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009		B1ARW8	110 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ldlrad1	D3YYZ1	218 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm4450	E9Q007	373 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp788	E9Q980	884 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sept7	O55131	436 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fgr	P14234	517 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 79.5 ms