RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641901.1

SAMMSON-222, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, human

BASIC

Gene SAMMSON, Length 2,727 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMMSON-222	ENST00000641901	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	TUBA4B	Q9H853	241 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	ABCA4	P78363	2273 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	SPINT2	O43291	252 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGKV1D-33	P01593	117 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGKV1-33	P01594	117 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	HBE1	P02100	147 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	RAB5A	P20339	215 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	RAB2A	P61019	212 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	RAB5B	P61020	215 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	MSMO1	Q15800	293 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF787	Q6DD87	383 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	USF3	Q68DE3	2245 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR2C1	O95371	312 aa		6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	CLDN14	O95500	239 aa		6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	SELL	P14151	372 aa		6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	BMP5	P22003	454 aa		6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF134	P52741	427 aa		6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	DLK1	P80370	383 aa		6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM209B	Q5JX69	171 aa		6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	DTD1	Q8TEA8	209 aa		6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	GNG12	Q9UBI6	72 aa		6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.41
SAMMSON-222	ENST00000641901	MARCH11	A6NNE9	402 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	CRYAA	P02489	173 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR9G9	P0C7N8	305 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	AGA	P20933	346 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	GPR12	P47775	334 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	EDDM3B	P56851	147 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR2B8P	P59922	312 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	RAB11A	P62491	216 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	HTD2	P86397	168 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM27E3	Q08E93	113 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	RNF212	Q495C1	297 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	MORN2	Q502X0	79 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	KHDC3L	Q587J8	217 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	LEAP2	Q969E1	77 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	RAB29	O14966	203 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	FCGR3B	O75015	233 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	ADH4	P08319	380 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR8U8	P0C7N1	319 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	BCL2	P10415	239 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	TDGF1P3	P51864	188 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	SERF2	P84101	59 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	TFF3	Q07654	80 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	MZT1	Q08AG7	82 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	TENM4	Q6N022	2769 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	ACSM6	Q6P461	480 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	SSX9	Q7RTT3	188 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	YPEL4	Q96NS1	127 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	SLC31A2	O15432	143 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	GZMH	P20718	246 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	GLRX	P35754	106 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	UQCRFS1	P47985	274 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	LOXL3	P58215	753 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SAMMSON-222	ENST00000641901	SST	P61278	116 aa		6.2	□□□□□ -1.42

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