RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF126Q9BV68 326 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCA2Q9BZC7 2435 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 PITX3O75364 302 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 MBPP02686 304 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 ARG1P05089 322 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 EPHA1P21709 976 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM65Q6PI78 240 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 R3HDM4Q96D70 268 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf159Q96HA4 380 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 TBX15Q96SF7 602 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35D1Q9NTN3 355 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 MARCH11A6NNE9 402 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 H0YJW9 148 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 CRYZL1O95825 349 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 LYL1P12980 280 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 PAX8Q06710 450 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 SMCO1Q147U7 214 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 RTL8BQ17RB0 113 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 Q5PR19 223 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS54Q6PEW0 395 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 MBD2Q9UBB5 411 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 SCGB1D2O95969 90 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 PET100P0DJ07 73 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 RRASP10301 218 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 S100A10P60903 97 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS57Q6UWY2 283 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFP57Q9NU63 452 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNG5Q9UF02 275 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS13CQ709C8 3753 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 K7EPK0 472 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 APOA2P02652 100 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 NQO2P16083 231 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 HTR1DP28221 377 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF546Q86UE3 836 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 COA4Q9NYJ1 87 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5AC2Q9NZP5 309 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 BOLA1Q9Y3E2 137 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 ARPC5O15511 151 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 TXNL1O43396 289 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 DEDDO75618 318 aa20.15■□□□□ 0.82
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CAPNS1-215ENST00000628018 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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CAPNS1-215ENST00000628018 MIDNQ504T8 468 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa20.15■□□□□ 0.82
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CAPNS1-215ENST00000628018 OR1S1Q8NH92 325 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 PLSCR3Q9NRY6 295 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 DPM3Q9P2X0 92 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFSF18Q9UNG2 199 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPB11Q9Y547 144 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 POMT1Q9Y6A1 747 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 MED13LQ71F56 2210 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa20.14■□□□□ 0.82
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CAPNS1-215ENST00000628018 B4DSR2 109 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 ST8SIA3O43173 380 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 SNAPC5O75971 98 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV1-16P04430 117 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 CXCL2P19875 107 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXRED2Q8IWF2 684 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 RPEQ96AT9 228 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa20.13■□□□□ 0.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 POU2AF1Q16633 256 aa20.13■□□□□ 0.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 PDZD9Q8IXQ8 264 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 DMBX1Q8NFW5 382 aa20.13■□□□□ 0.81
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CAPNS1-215ENST00000628018 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 H7C2Y5 167 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 HRASP01112 189 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 RLN2P04090 185 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 CEACAM3P40198 252 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2E1P51965 193 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 ERVK-16P61578 105 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM177Q53S58 311 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 DCUN1D4Q92564 292 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 WASHC3Q9Y3C0 194 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGDIBP52566 201 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 SSX9Q7RTT3 188 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 LHX4Q969G2 390 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-215ENST00000628018 RHOVQ96L33 236 aa20.12■□□□□ 0.81
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