RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF283Q8N7M2 679 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 WDR31Q8NA23 367 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OR51A2Q8NGJ7 313 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 FGGYQ96C11 551 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 POM121L2Q96KW2 1035 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 LIME1Q9H400 295 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 COMMD3Q9UBI1 195 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OR5V1Q9UGF6 321 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 V9GY05 133 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 COL12A1Q99715 3063 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 UPK1BO75841 260 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 DHRS3O75911 302 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 CD2P06729 351 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 PAX1P15863 534 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 FCGR2CP31995 323 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 OR8B8Q15620 311 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 DNM1P46Q6ZS02 220 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 A6NIN4 97 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 PMS2P5A8MQ11 134 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 HES5Q5TA89 166 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 MDP1Q86V88 176 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 OR5D14Q8NGL3 314 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 OR56B4Q8NH76 319 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OR2AE1Q8NHA4 323 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 TMEM138Q9NPI0 162 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 IFT46Q9NQC8 304 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF391Q9UJN7 358 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 COL6A6A6NMZ7 2263 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 A0A0G2JMP0 313 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 A0A0X1KG70 313 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GVG6 124 aa3.27□□□□□ -1.89
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