RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRGV3P03979 118 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DUTP33316 252 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SDC2P34741 201 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VMA21Q3ZAQ7 101 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CNIH2Q6PI25 160 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TEX45Q8NA69 505 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DDB2Q92466 427 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR51E2Q9H255 320 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR2W1Q9Y3N9 320 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAH3Q8TD57 4116 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM127O75204 238 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GNG2P59768 71 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBE2KP61086 200 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PJVKQ0ZLH3 352 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCTD21Q4G0X4 260 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POC5Q8NA72 575 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR5T1Q8NG75 326 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C5orf30Q96GV9 206 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRR25Q96S07 402 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RHBDL2Q9NX52 303 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ETV7Q9Y603 341 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A087WW49 117 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM235A6NFC5 223 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SAP30O75446 220 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGHV3-11P01762 117 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HLA-DQB1P01920 261 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLURP1P55000 103 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACSM6Q6P461 480 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF645Q8N7E2 425 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LGALS14Q8TCE9 139 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANXA10Q9UJ72 324 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A0A6YYH2 397 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A6NJ64 397 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINC00473A8K010 186 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRYZL1O95825 349 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD36P16671 472 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZP3P21754 424 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MXD1Q05195 221 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRSS8Q16651 343 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C11orf87Q6NUJ2 197 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR4C12Q96R67 309 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MSGN1A6NI15 193 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SSX5O60225 188 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LY86O95711 162 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AADACP22760 399 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NEDD8Q15843 81 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IDNKQ5T6J7 187 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USMG5Q96IX5 58 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DIABLOQ9NR28 239 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COL7A1Q02388 2944 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRAV18A0A075B6X5 111 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 J3QRK9 145 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACTL6BO94805 426 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLEC2LP0C7M8 214 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCTD9Q7L273 389 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OVCH2Q7RTZ1 564 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CROCCP3Q8IVE0 287 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PHB2Q99623 299 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FCGR3BO75015 233 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TUSC2O75896 110 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDK10Q15131 360 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TNXAQ16473 311 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MMD2Q8IY49 270 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BEST4Q8NFU0 473 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR5H6Q8NGV6 325 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC25A38Q96DW6 304 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPIN2AQ99865 258 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF167Q9H6Y7 350 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COA4Q9NYJ1 87 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPATA2Q9UM82 520 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 149.9 ms