RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 NAV1Q8NEY1 1877 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTPRBP23467 1997 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAV7A0A075B6U4 112 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 SGCEO43556 437 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 TNFAIP8O95379 198 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 CST4P01036 141 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPBPP02775 128 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 FXYD7P58549 80 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAS2R20P59543 309 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 TBPL1P62380 186 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM249Q2WGJ8 235 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 C10orf55Q5SWW7 151 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 HBEGFQ99075 208 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM208Q9BTX3 173 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPATQ14207 1427 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIAA0232Q92628 1395 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A087WUU8 490 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A0J9YW62 118 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 MEIS3P1A6NDR6 274 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 F5H5K5 113 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 H3BT86 120 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOLGA8RI6L899 631 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRGC1P0CF51 173 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 CFL1P23528 166 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 ETV1P50549 477 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDK10Q15131 360 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 C9orf64Q5T6V5 341 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC22A24Q8N4F4 322 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRC45Q96CN5 670 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 TLCD1Q96CP7 247 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 MS4A6EQ96DS6 147 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMIM12Q96EX1 92 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM210AQ96ND0 272 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 ENPP5Q9UJA9 477 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 SETD5Q9C0A6 1442 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 M0R381 172 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL28P46779 137 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM33P57088 247 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB8AP61006 207 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB14P61106 215 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 LCN8Q6JVE9 175 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q8WTZ3 238 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 BRWD1Q9NSI6 2320 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 GLI3P10071 1580 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 DLX6P56179 175 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 TEX36Q5VZQ5 186 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 C12orf29Q8N999 325 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF565Q8N9K5 539 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 NAT8Q9UHE5 227 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMARCA4P51532 1647 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-38P-201ENST00000384085 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUP160Q12769 1436 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR6C6A6NF89 314 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR51F1A6NGY5 319 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 H0YC42 278 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 MPZL2O60487 215 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC172P0C7W6 258 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBBP0CG47 229 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 H2BFSP57053 126 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 AKR1C1Q04828 323 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 STX3Q13277 289 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR4D1Q15615 310 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 C9orf163Q8N9P6 203 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 RORBQ92753 470 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 TESCQ96BS2 214 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 SERPINB11Q96P15 392 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 SERPINI1Q99574 410 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHST6Q9GZX3 395 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRABDQ9H4I3 376 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 GMEB1Q9Y692 573 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 ITGB1BP1O14713 200 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP8B1O43520 1251 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 SYNGR1O43759 233 aa0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms