RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055506.8

Gtf3c1-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c1, Length 6,961 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Wnt11P48615 354 aa9.9□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 TepsinQ3U3N6 573 aa9.9□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cln5Q3UMW8 341 aa9.9□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Bst1Q64277 311 aa9.9□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Adam26bQ6IMH6 699 aa9.9□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1512Q8VF72 313 aa9.9□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1427Q8VFU9 311 aa9.9□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Hdac8Q8VH37 377 aa9.9□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmem126bQ9D1R1 230 aa9.9□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 PrnA0A075B668 197 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tnfrsf14A0A1W2P7D5 276 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm8677K9J7G9 307 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 March5Q3KNM2 278 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Q3U6N9 222 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rnf223Q3UV31 285 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ubald1Q6P3B2 176 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rcc1lQ9CYF5 461 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Klkb1P26262 638 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Abhd14bQ8VCR7 210 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fam174aQ9D3L0 190 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Onecut1O08755 465 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Spink11Q09TK7 88 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cnrip1Q5M8N0 164 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Crb2Q80YA8 1282 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pitpnc1Q8K4R4 332 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Elf5Q8VDK3 253 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr483Q8VG05 315 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Wdr13Q91V09 485 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pi4kaE9Q3L2 2105 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn1r194J3JS27 296 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Trav5d-4Q5R1F6 114 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Klf4Q60793 483 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cox14Q8BH51 57 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cadm4Q8R464 388 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 1700025F22RikQ9D9Y7 111 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmub1Q9JMG3 245 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Phrf1A6H619 1682 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ighv7-1A0A075B5S2 121 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ighv9-2A0A0B4J1J4 117 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm13420A0A140LJJ2 248 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ube2l3P68037 154 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gfra1P97785 468 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Defa20Q45VN2 95 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Taar9Q5QD04 348 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmprss13Q5U405 543 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 RalyQ64012 312 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dlx1Q64317 255 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cldn15Q9Z0S5 227 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dock10Q8BZN6 2150 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cmpk2Q3U5Q7 447 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr411Q7TRW8 315 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 C1rbQ8CFG9 706 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr46Q8VGJ4 318 aa9.89□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mtatp6P00848 226 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gcnt2P97402 401 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc45a1Q8BIV7 751 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Lancl3Q8CD19 420 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmem56Q8CGF5 276 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr435Q8VFS3 313 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ssmem1Q9D9Y8 244 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fscn3Q9QXW4 498 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 TapbpQ9R233 465 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm44596A0A0N4SVA0 210 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ankrd60A2AMD2 318 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zbtb25G3UW50 439 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cldn34c3J3QJW5 233 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mfsd4b3Q3UN21 355 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1286Q7TQY2 305 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1282Q7TQY5 305 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr987Q7TRA2 309 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Phf13Q8K2W6 296 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Atp6v1fQ9D1K2 119 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Skint9A7TZG3 319 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1079Q8VF52 315 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1030Q8VFL5 318 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr56Q8VGD6 315 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Alpk3Q924C5 1678 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Col2a1P28481 1487 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ldlrad3A2AR95 345 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Omt2bD3YX29 119 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dok1P97465 482 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 PilrbQ2YFS2 224 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 BocQ6AZB0 1110 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sh2d5Q8JZW5 429 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Abca7Q91V24 2159 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1104A2AVB5 310 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Prr23a2D3YWX5 253 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 PpiaP17742 164 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Il11P47873 199 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mob3aQ8BSU7 217 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ndufaf3Q9JKL4 185 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dlg5E9Q9R9 1921 aa9.88□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm4779A0A1B0GR91 561 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn1r175K7N6T9 304 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gfra3O35118 397 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 MdkP12025 140 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cnn1Q08091 297 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tff1Q08423 87 aa9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Btf3Q64152 204 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gramd2bQ6PEM6 445 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.8 ms