Protein–RNA interactions for Protein: P97402

Gcnt2, N-acetyllactosaminide beta-1,6-N-acetylglucosaminyl-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt2P97402 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Gcnt2P97402 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gcnt2P97402 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gcnt2P97402 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gcnt2P97402 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gcnt2P97402 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gcnt2P97402 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Gcnt2P97402 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gcnt2P97402 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Gcnt2P97402 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Gcnt2P97402 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gcnt2P97402 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gcnt2P97402 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gcnt2P97402 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Gcnt2P97402 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gcnt2P97402 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gcnt2P97402 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gcnt2P97402 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gcnt2P97402 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gcnt2P97402 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gcnt2P97402 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gcnt2P97402 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gcnt2P97402 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gcnt2P97402 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Gcnt2P97402 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gcnt2P97402 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcnt2P97402 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcnt2P97402 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcnt2P97402 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gcnt2P97402 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gcnt2P97402 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gcnt2P97402 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gcnt2P97402 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gcnt2P97402 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gcnt2P97402 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gcnt2P97402 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcnt2P97402 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gcnt2P97402 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Gcnt2P97402 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gcnt2P97402 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gcnt2P97402 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gcnt2P97402 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gcnt2P97402 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gcnt2P97402 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gcnt2P97402 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gcnt2P97402 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Gcnt2P97402 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gcnt2P97402 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gcnt2P97402 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gcnt2P97402 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gcnt2P97402 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gcnt2P97402 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gcnt2P97402 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gcnt2P97402 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gcnt2P97402 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gcnt2P97402 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gcnt2P97402 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcnt2P97402 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gcnt2P97402 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gcnt2P97402 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gcnt2P97402 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gcnt2P97402 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcnt2P97402 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcnt2P97402 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcnt2P97402 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Gcnt2P97402 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcnt2P97402 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcnt2P97402 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcnt2P97402 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcnt2P97402 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcnt2P97402 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcnt2P97402 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcnt2P97402 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gcnt2P97402 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gcnt2P97402 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gcnt2P97402 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gcnt2P97402 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcnt2P97402 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcnt2P97402 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcnt2P97402 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gcnt2P97402 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gcnt2P97402 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gcnt2P97402 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gcnt2P97402 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gcnt2P97402 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gcnt2P97402 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gcnt2P97402 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gcnt2P97402 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt2P97402 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gcnt2P97402 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gcnt2P97402 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gcnt2P97402 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcnt2P97402 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gcnt2P97402 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gcnt2P97402 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gcnt2P97402 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gcnt2P97402 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcnt2P97402 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcnt2P97402 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcnt2P97402 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms