RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	TFAP2A	P05549	437 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	FCGR3A	P08637	254 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	GNB3	P16520	340 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	TPPP2	P59282	170 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ACTBL2	Q562R1	376 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	C5orf30	Q96GV9	206 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	OR2D2	Q9H210	308 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	GHITM	Q9H3K2	345 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	PDCD5	O14737	125 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	OR8U9	P0C7N5	309 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	FXYD3	Q14802	87 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	PDPN	Q86YL7	162 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ARPC1A	Q92747	370 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	RNF5	Q99942	180 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618		U3KQK5	164 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ERICH4	A6NGS2	130 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	IFITM5	A6NNB3	132 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	TRGV3	P03979	118 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	MYL9	P24844	172 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	PSMD7	P51665	324 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	DEFA5	Q01523	94 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5T1	Q8NG75	326 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	MFNG	O00587	321 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	SPDEF	O95238	335 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	CNIH1	O95406	144 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	IGLV2-23	P01705	113 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	SPN	P16150	400 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	RAB3B	P20337	219 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	GADD45A	P24522	165 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	SERPINB10	P48595	397 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	HSPA13	P48723	471 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	INSL3	P51460	131 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ARFRP1	Q13795	201 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF429	Q86V71	674 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	BVES	Q8NE79	360 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	SORL1	Q92673	2214 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618		J3QRK9	145 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	RAB27B	O00194	218 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	APELA	P0DMC3	54 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	RAB6A	P20340	208 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	PITPNA	Q00169	270 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	RHOV	Q96L33	236 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	HARBI1	Q96MB7	349 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	GINS4	Q9BRT9	223 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	RYR3	Q15413	4870 aa		11.27	□□□□□ -0.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	SHOX	O15266	292 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	CRYGB	P07316	175 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	CD40LG	P29965	261 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	TALDO1	P37837	337 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	RANBP1	P43487	201 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	ACSM6	Q6P461	480 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	GP9	P14770	177 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	PSMB9	P28065	219 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	POC5	Q8NA72	575 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ATG4B-223	ENST00000493618	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		11.25	□□□□□ -0.61

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