RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430287.1

USP9YP16-201, Transcript of USP9Y pseudogene 16, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP16, Length 407 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP16-201ENST00000430287 UBE2KP61086 200 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 TMEM31Q5JXX7 168 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 C9orf163Q8N9P6 203 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 IFT81Q8WYA0 676 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 HBEGFQ99075 208 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 HINT2Q9BX68 163 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 RAB1BQ9H0U4 201 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 COMMD9Q9P000 198 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 TAAR3PQ9P1P4 343 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 SNX10Q9Y5X0 201 aa0.07□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 HMSDA8MTL9 139 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 TXNDC9O14530 226 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 SCN2BO60939 215 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 UGT2B11O75310 529 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 OR10J1P30954 320 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 CD79BP40259 229 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 CA7P43166 264 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 AQP4P55087 323 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 C1DQ13901 141 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 DAND5Q8N907 189 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 TMEM239Q8WW34 195 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 UGT2B28Q9BY64 529 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 TMEM222Q9H0R3 208 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 HEATR5AQ86XA9 2040 aa0.06□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 WDR90Q96KV7 1748 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 KLRC4O43908 158 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 CSTAP01040 98 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 TPM2P07951 284 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 NQO2P16083 231 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 AGTR1P30556 359 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 GABRA2P47869 451 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 SNAP25P60880 206 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 DAD1P61803 113 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 GNA12Q03113 381 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 FLOT2Q14254 428 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 ELOBQ15370 118 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 MIAQ16674 131 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 MESTQ5EB52 335 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 XKRXQ6PP77 449 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 DCXRQ7Z4W1 244 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 RORBQ92753 470 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 CCDC127Q96BQ5 260 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 SFRP2Q96HF1 295 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 FAM210AQ96ND0 272 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 OR7D2Q96RA2 312 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 EML5Q05BV3 1969 aa0.05□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 NPATQ14207 1427 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 A0A087WUU8 490 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 A0A0D9SEW6 157 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 A0A1B0GW15 77 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 H7C2G1 150 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 ARL6IP5O75915 188 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 SNAP29O95721 258 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 CST4P01036 141 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 LIMS3P0CW19 117 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 LIMS4P0CW20 117 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 EMP1P54849 157 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 HERVK_113P63121 156 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 RAB31Q13636 194 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 TMEM249Q2WGJ8 235 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 LRRC6Q86X45 466 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 DYNAPQ8N1N2 210 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 ZNF675Q8TD23 568 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 LRRC39Q96DD0 335 aa0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 PTPRSQ13332 1948 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 TRAV7A0A075B6U4 112 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 A0A0J9YW62 118 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 RAB19A4D1S5 217 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 F5H5K5 113 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 MRASO14807 208 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 SGCEO43556 437 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 HBZP02008 142 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 PSMB8P28062 276 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 CRATP43155 626 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 ETV1P50549 477 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 FXYD7P58549 80 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 TPI1P60174 286 aa0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
USP9YP16-201ENST00000430287 EXOC3L4Q17RC7 722 aa0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms