RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000068056.11

Ddx39b-201, Transcript of Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ddx39b, Length 1,739 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Q504N7 393 aa14.86□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Vmn1r74Q8R290 304 aa14.86□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr1361Q8VFH0 317 aa14.86□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Prss37Q9DAA4 237 aa14.86□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cacna1iE9Q7P2 2199 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Igkv1-135A0A0B4J1H7 120 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 S100zB9EJL3 99 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 CidebO70303 219 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 IslrQ6GU68 428 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr1211Q7TR09 311 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nmnat2Q8BNJ3 307 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Inpp5kQ8C5L6 468 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Scgb2b26Q8JZX1 112 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 RbksQ8R1Q9 323 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr1462Q8VFW3 307 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Lmo1Q924W9 156 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tbx19Q99ME7 446 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ndufb7Q9CR61 137 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Neurl2Q9D0S4 285 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tsc22d4Q9EQN3 387 aa14.85□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm21833J3QPK1 500 aa14.84□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 PhyhO35386 338 aa14.84□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 LtaP09225 202 aa14.84□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Foxa2P35583 459 aa14.84□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sf3b6P59708 125 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Uba52P62984 128 aa14.84□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm10912Q3UXH0 145 aa14.84□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr1477Q7TQQ7 315 aa14.84□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc22a22Q8R0S9 554 aa14.84□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr303Q8VFP0 319 aa14.84□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr678Q8VG26 313 aa14.84□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 MynnQ99MD8 610 aa14.84□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sytl3Q99N48 607 aa14.84□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Lnp1A0A1B0GSK3 178 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 AI182371A2AS37 356 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr1410E9PYK6 323 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm21921J3QNB5 361 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr224M9MMJ7 314 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nrg3O35181 713 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 NppaP05125 152 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ube2e1P52482 193 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Actg1P63260 375 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Smrp1Q2MH31 260 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rnft2Q3UF64 445 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zfp947Q8BIQ6 437 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zfp874aQ8BX23 447 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 PhyhipQ8K0S0 330 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rab15Q8K386 212 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mmgt2Q8R3L0 123 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Siglec12Q91Y57 467 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cysltr2Q920A1 309 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Coq5Q9CXI0 327 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 CenpvQ9CXS4 252 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nol3Q9D1X0 220 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gnpnat1Q9JK38 184 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 TpbgQ9Z0L0 426 aa14.83□□□□□ -0.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Prr23a2D3YWX5 253 aa14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm21994F6T2D2 329 aa14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc18a3O35304 530 aa14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Glp1rO35659 463 aa14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr143P34985 313 aa14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rpl29P47915 160 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dlx6P70397 175 aa14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Foxf1Q61080 378 aa14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 ScocQ78YZ6 125 aa14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Vmn1r201Q8R262 300 aa14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Taf9Q8VI33 264 aa14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Scgb3a1Q920D7 104 aa14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Znf593Q9DB42 134 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr943Q9EQ92 314 aa14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Klrc3Q9QXN7 221 aa14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm3550W4VSN7 160 aa14.83□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr1274-psA0A1L1SQ02 309 aa14.82□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm21788J3QNH3 180 aa14.82□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 MyadmO35682 320 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 CntfrO88507 372 aa14.82□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Scd2P13011 358 aa14.82□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 PitpnbP53811 271 aa14.82□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm826Q3UQ74 109 aa14.82□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm10840Q3V2K9 103 aa14.82□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kbtbd11Q8BNW9 633 aa14.82□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr809Q8VEX8 328 aa14.82□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Asah1Q9WV54 394 aa14.82□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ighv5-15A0A0A6YWC7 117 aa14.81□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr175-ps1A0A140T8K4 308 aa14.81□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr1192-ps1A0A1L1SRD7 309 aa14.81□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 CtcflA2APF3 636 aa14.81□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm10477F6SW83 55 aa14.81□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 P01643 108 aa14.81□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cd74P04441 279 aa14.81□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Barhl1P63157 327 aa14.81□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dirc2Q8BFQ6 478 aa14.81□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gpr4Q8BUD0 365 aa14.81□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 GmfbQ9CQI3 142 aa14.81□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Immp1lQ9CQU8 166 aa14.81□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Polr3kQ9CQZ7 108 aa14.81□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Q9DAD0 168 aa14.81□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hebp2Q9WU63 205 aa14.81□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ankrd29D3YVV3 309 aa14.8□□□□□ -0.04
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 P01796 113 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 59 ms