Protein–RNA interactions for Protein: O35386

Phyh, Phytanoyl-CoA dioxygenase, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhyhO35386 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PhyhO35386 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PhyhO35386 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PhyhO35386 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PhyhO35386 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PhyhO35386 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PhyhO35386 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PhyhO35386 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PhyhO35386 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PhyhO35386 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PhyhO35386 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PhyhO35386 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PhyhO35386 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PhyhO35386 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PhyhO35386 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PhyhO35386 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PhyhO35386 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PhyhO35386 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PhyhO35386 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PhyhO35386 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PhyhO35386 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PhyhO35386 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PhyhO35386 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PhyhO35386 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PhyhO35386 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PhyhO35386 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PhyhO35386 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PhyhO35386 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PhyhO35386 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PhyhO35386 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PhyhO35386 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PhyhO35386 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PhyhO35386 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PhyhO35386 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PhyhO35386 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PhyhO35386 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PhyhO35386 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PhyhO35386 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PhyhO35386 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PhyhO35386 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PhyhO35386 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PhyhO35386 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PhyhO35386 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PhyhO35386 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PhyhO35386 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PhyhO35386 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PhyhO35386 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PhyhO35386 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PhyhO35386 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PhyhO35386 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PhyhO35386 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PhyhO35386 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PhyhO35386 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PhyhO35386 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PhyhO35386 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PhyhO35386 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PhyhO35386 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PhyhO35386 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PhyhO35386 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PhyhO35386 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PhyhO35386 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PhyhO35386 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PhyhO35386 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PhyhO35386 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PhyhO35386 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PhyhO35386 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PhyhO35386 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PhyhO35386 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PhyhO35386 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PhyhO35386 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PhyhO35386 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PhyhO35386 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PhyhO35386 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PhyhO35386 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PhyhO35386 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PhyhO35386 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PhyhO35386 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PhyhO35386 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PhyhO35386 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PhyhO35386 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PhyhO35386 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PhyhO35386 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PhyhO35386 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PhyhO35386 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PhyhO35386 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PhyhO35386 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PhyhO35386 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PhyhO35386 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PhyhO35386 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PhyhO35386 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PhyhO35386 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PhyhO35386 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PhyhO35386 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PhyhO35386 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PhyhO35386 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PhyhO35386 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PhyhO35386 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PhyhO35386 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PhyhO35386 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PhyhO35386 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms