Protein–RNA interactions for Protein: O35181

Nrg3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrg3O35181 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Nrg3O35181 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Nrg3O35181 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Nrg3O35181 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Nrg3O35181 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32■■■□□ 2,71
Nrg3O35181 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Nrg3O35181 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Nrg3O35181 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Nrg3O35181 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Nrg3O35181 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Nrg3O35181 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Nrg3O35181 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Nrg3O35181 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Nrg3O35181 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Nrg3O35181 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Nrg3O35181 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Nrg3O35181 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Nrg3O35181 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Nrg3O35181 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Nrg3O35181 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Nrg3O35181 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Nrg3O35181 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Nrg3O35181 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Nrg3O35181 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Nrg3O35181 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Nrg3O35181 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Nrg3O35181 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Nrg3O35181 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Nrg3O35181 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Nrg3O35181 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Nrg3O35181 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Nrg3O35181 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Nrg3O35181 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Nrg3O35181 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Nrg3O35181 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Nrg3O35181 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Nrg3O35181 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Nrg3O35181 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Nrg3O35181 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Nrg3O35181 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Nrg3O35181 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Nrg3O35181 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Nrg3O35181 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Nrg3O35181 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Nrg3O35181 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Nrg3O35181 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Nrg3O35181 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Nrg3O35181 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Nrg3O35181 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Nrg3O35181 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Nrg3O35181 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
Nrg3O35181 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Nrg3O35181 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Nrg3O35181 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Nrg3O35181 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Nrg3O35181 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Nrg3O35181 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Nrg3O35181 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Nrg3O35181 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Nrg3O35181 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Nrg3O35181 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Nrg3O35181 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Nrg3O35181 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Nrg3O35181 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Nrg3O35181 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Nrg3O35181 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Nrg3O35181 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Nrg3O35181 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Nrg3O35181 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Nrg3O35181 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,96
Nrg3O35181 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Nrg3O35181 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Nrg3O35181 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Nrg3O35181 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Nrg3O35181 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Nrg3O35181 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Nrg3O35181 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Nrg3O35181 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Nrg3O35181 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Nrg3O35181 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Nrg3O35181 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Nrg3O35181 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Nrg3O35181 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Nrg3O35181 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Nrg3O35181 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Nrg3O35181 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Nrg3O35181 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Nrg3O35181 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Nrg3O35181 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Nrg3O35181 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Nrg3O35181 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Nrg3O35181 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Nrg3O35181 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Nrg3O35181 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Nrg3O35181 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
Nrg3O35181 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Nrg3O35181 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Nrg3O35181 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Nrg3O35181 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Nrg3O35181 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50,3 ms