RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 ETV7Q9Y603 341 aa11.69□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 NBR2O15453 112 aa11.68□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 OPN1MWP04001 364 aa11.68□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 OPN1MW2P0DN77 364 aa11.68□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 OPN1MW3P0DN78 364 aa11.68□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 SOX6P35712 828 aa11.68□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 SERPINB10P48595 397 aa11.68□□□□□ -0.54
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RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF383Q8NA42 475 aa11.68□□□□□ -0.54
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RABGGTA-211ENST00000559850 PHF21AQ96BD5 680 aa11.68□□□□□ -0.54
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RABGGTA-211ENST00000559850 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
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RABGGTA-211ENST00000559850 G3V4G9 280 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 AP4M1O00189 453 aa11.67□□□□□ -0.54
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RABGGTA-211ENST00000559850 ARL6IP1Q15041 203 aa11.67□□□□□ -0.54
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RABGGTA-211ENST00000559850 OR4F17Q8NGA8 305 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 OR5AN1Q8NGI8 311 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 OR13F1Q8NGS4 319 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 OR4F4Q96R69 305 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 TOLLIPQ9H0E2 274 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 FBXL15Q9H469 300 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 SDHAF2Q9NX18 166 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 SPATA2Q9UM82 520 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 WASHC3Q9Y3C0 194 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 MEIS3P1A6NDR6 274 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 OR5H14A6NHG9 310 aa11.66□□□□□ -0.54
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RABGGTA-211ENST00000559850 IGKV1-16P04430 117 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 TFAP2AP05549 437 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 C5orf64Q2M2E5 130 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 Q6ZS49 121 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 GVQW1Q8N7I0 195 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 NPBQ8NG41 125 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 CLCC1Q96S66 551 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 PARP11Q9NR21 331 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 WSB1Q9Y6I7 421 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 G3V318 75 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 FCN1O00602 326 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 ATP6V0E1O15342 81 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 SCGNO76038 276 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 NDUFA3O95167 84 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
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RABGGTA-211ENST00000559850 SCAND1P57086 179 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC35B1P78383 322 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 NDPQ00604 133 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 LIN54Q6MZP7 749 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 C8orf86Q6ZUL3 223 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 SAMD12Q8N8I0 201 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 GHITMQ9H3K2 345 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 AUNIPQ9H7T9 357 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 TPSG1Q9NRR2 321 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 KIAA1456Q9P272 454 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 NUDT19A8MXV4 375 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 RRHO14718 337 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 HLA-DRB1P01911 266 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 VDAC1P21796 283 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 PITPNAQ00169 270 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 CFHR3Q02985 330 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 PLGLAQ15195 96 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 OXLD1Q5BKU9 147 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 DUX3Q96PT4 197 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 DCSTAMPQ9H295 470 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 OR51J1Q9H342 316 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 DIABLOQ9NR28 239 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC35D1Q9NTN3 355 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 ANXA10Q9UJ72 324 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 GAB2Q9UQC2 676 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 FBXO7Q9Y3I1 522 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 APOA2P02652 100 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 PF4P02776 101 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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RABGGTA-211ENST00000559850 RPS16P62249 146 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 PSG5Q15238 335 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 UBE2NLQ5JXB2 153 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 GPR107Q5VW38 600 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 CNIH2Q6PI25 160 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 CROCCP3Q8IVE0 287 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 BVESQ8NE79 360 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC25A46Q96AG3 418 aa11.63□□□□□ -0.55
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