RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 VSIG10L2P0DP72 767 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 NAT1P18440 290 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 F2RL1P55085 397 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 CD83Q01151 205 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 MZT2AQ6P582 158 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 BEST4Q8NFU0 473 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 OR8U1Q8NH10 309 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 AP3S1Q92572 193 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 GINS4Q9BRT9 223 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 ZNF580Q9UK33 172 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 ANAPC10Q9UM13 185 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 OR2W1Q9Y3N9 320 aa9.57□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 SLC22A5O76082 557 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 NDUFA3O95167 84 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 TAS2R20P59543 309 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 ACTBP60709 375 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 RITA1Q96K30 269 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.56□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 M0QZ24 198 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 KCNAB3O43448 404 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 PEX14O75381 377 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 FBXO24O75426 580 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 ELK1P19419 428 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 PRSS3P35030 304 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 LUMP51884 338 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 MSMO1Q15800 293 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 C5orf64Q2M2E5 130 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 FAM131AQ6UXB0 335 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 SLC35E3Q7Z769 313 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 ZNF383Q8NA42 475 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 GPX8Q8TED1 209 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 CHPT1Q8WUD6 406 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 GIMAP1Q8WWP7 306 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 ADTRPQ96IZ2 230 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.55□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 M0R1X1 148 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 AP4M1O00189 453 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 SULT1C2O00338 296 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 NBR2O15453 112 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 HPGDSO60760 199 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 HLA-DRB1P01911 266 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 PTHLHP12272 177 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 SOX6P35712 828 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 LGALS7P47929 136 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 THBS3P49746 956 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 SPCS2Q15005 226 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 MMDQ15546 238 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 DHRS11Q6UWP2 260 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 PDPNQ86YL7 162 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 OR5AP2Q8NGF4 316 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 SNAPC3Q92966 411 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 C5orf30Q96GV9 206 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 OR2D2Q9H210 308 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 SCOCQ9UIL1 159 aa9.54□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 LINC01548A6NM66 108 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 RRHO14718 337 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 SPDEFO95238 335 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 IGLV2-14P01704 120 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 APOA2P02652 100 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 IGF1P05019 195 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 RRASP10301 218 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 CD28P10747 220 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 DUTP33316 252 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 LINC00205P59089 165 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 TMEM177Q53S58 311 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 LIN54Q6MZP7 749 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 TREML4Q6UXN2 200 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 LYSMD2Q8IV50 215 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 FOXRED2Q8IWF2 684 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 COMMD1Q8N668 190 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 ZNF645Q8N7E2 425 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 DDB2Q92466 427 aa9.53□□□□□ -0.88
HPS1-206ENST00000462743 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms