RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 GAB2Q9UQC2 676 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TENM3Q9P273 2699 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A0A6YYD4 124 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 H0YJW9 148 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFA3O95167 84 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 CA2P00918 260 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 APOA2P02652 100 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 CD3GP09693 182 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 CLDN12P56749 244 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00205P59089 165 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 HLA-DRB3P79483 266 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 RUNX1Q01196 453 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 PSG5Q15238 335 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 RAB11BQ15907 218 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TM2D1Q9BX74 207 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ZMAT4Q9H898 229 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 PALMDQ9NP74 551 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF580Q9UK33 172 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 M0R1X1 148 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 BET1O15155 118 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC22A1O15245 554 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC25A17O43808 307 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 SOX15O60248 233 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 RBBP9O75884 186 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ARL6IP5O75915 188 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 NAPSAO96009 420 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TFAP2AP05549 437 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 OR8U9P0C7N5 309 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 GP9P14770 177 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 NDPQ00604 133 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 CBX3Q13185 183 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 FXYD3Q14802 87 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 HES5Q5TA89 166 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 RCHY1Q96PM5 261 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 PHB2Q99623 299 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 PECRQ9BY49 303 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 Q9N2K0 584 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 RDH8Q9NYR8 311 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TRDCB7Z8K6 153 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 C3orf84H3BNL1 204 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 J3QRK9 145 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC17A2O00624 439 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 MPPED1O15442 326 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 RGS10O43665 173 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 UCHL1P09936 223 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 APELAP0DMC3 54 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TALDO1P37837 337 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 QRFPP83859 136 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAM1Q15629 374 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ACSM6Q6P461 480 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms