RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 MC5RP33032 325 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 UCNP55089 124 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 RARRES2Q99969 163 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM140Q9NV12 185 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 IFNL4K9M1U5 179 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 NUDT3O95989 172 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 BGLAPP02818 100 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 CD1AP06126 327 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 ERVFRD-1P60508 538 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 RTP5Q14D33 572 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 PRELID3AQ96N28 172 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 GGACTQ9BVM4 153 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 WNT16Q9UBV4 365 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM189A5PLL7 270 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 MPTX1A8MV57 137 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 OR2A4O95047 310 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 IFI6P09912 130 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 MPLP40238 635 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 TNFSF10P50591 281 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 CRYBA2P53672 197 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 HERPUD1Q15011 391 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 OR2A7Q96R45 310 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 OR4C46A6NHA9 309 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 FCARP24071 287 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF137PP52743 207 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 PRSS8Q16651 343 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 PSMG4Q5JS54 123 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 OR1P1Q8NH06 330 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 GALNT14Q96FL9 552 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 CDIPTO14735 213 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 TSPOP30536 169 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 PMELP40967 661 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 LOXL3P58215 753 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 ZP1P60852 638 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 GGTLC2Q14390 218 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF519Q8TB69 540 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 PAXXQ9BUH6 204 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 SIP14410 1827 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 S1PR2O95136 353 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1D-16P01601 117 aa7.69□□□□□ -1.18
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PTPRM-202ENST00000400053 MMDQ15546 238 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 GABRA6Q16445 453 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 GUSBP11Q6P575 273 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 DDA1Q9BW61 102 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00587B1AMM8 73 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 C21orf140B9A014 251 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 J3QR06 171 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFB4O95168 129 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 TRGC1P0CF51 173 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 HKR1P10072 659 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 RND3P61587 244 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 RAX2Q96IS3 184 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 UCN2Q96RP3 112 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 GPHA2Q96T91 129 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 P2RX4Q99571 388 aa7.69□□□□□ -1.18
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PTPRM-202ENST00000400053 RNF224P0DH78 156 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 ABHD3Q8WU67 409 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 FAM131CQ96AQ9 280 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 CHST5Q9GZS9 411 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 R4GN57 208 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 C4orf51C9J302 202 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 UPK3AO75631 287 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 SOD3P08294 240 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 TUBD1Q9UJT1 453 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0G2JMZ2 1700 aa7.68□□□□□ -1.18
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