RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328020.10

CMTM1-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM1, Length 981 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-201ENST00000328020 ADTRPQ96IZ2 230 aa11.37□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 ATRQ13535 2644 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 H3BUX3 64 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 J3QRK9 145 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 M0QYG6 137 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 TIMM23O14925 209 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 MC5RP33032 325 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 ECI1P42126 302 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 REG1BP48304 166 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 FXYD4P59646 89 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 CBX3Q13185 183 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 THNSL2Q86YJ6 484 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 ODF3L1Q8IXM7 274 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 DYNAPQ8N1N2 210 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 AKR1E2Q96JD6 320 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 PRRT1Q99946 306 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 CCDC32Q9BV29 185 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 SLC5A7Q9GZV3 580 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 AKIP1Q9NQ31 210 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 VPREB3Q9UKI3 123 aa11.36□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 A0A1W2PPI3 338 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 CENPXA8MT69 81 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 M0R1X1 148 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 IGHV4-59P01825 116 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 APOA2P02652 100 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 AMY2AP04746 511 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 CD1BP29016 333 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 CD40LGP29965 261 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 RAB13P51153 203 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 SLC9A3R2Q15599 337 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 RPL39P5Q59GN2 51 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 CMTM1Q8IZ96 169 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 MFSD4AQ8N468 514 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 DRAM1Q8N682 238 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 OR56B4Q8NH76 319 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 MOB3AQ96BX8 217 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 MCUBQ9NWR8 336 aa11.35□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 OR5H14A6NHG9 310 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 CRYBA1P05813 215 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 RRASP10301 218 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 THBS3P49746 956 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 PPP5CP53041 499 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 RPL15P61313 204 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 HES1Q14469 280 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 C16orf82Q7Z2V1 217 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 SLC38A6Q8IZM9 456 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 OR2T10Q8NGZ9 312 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 TERB2Q8NHR7 220 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 ZFAND2BQ8WV99 257 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 TRIM63Q969Q1 353 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 SDHAF2Q9NX18 166 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 TCF19Q9Y242 345 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM1-201ENST00000328020 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 RNF212BA8MTL3 300 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 H7C2Y5 167 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 M0QZK8 103 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 MOSP00540 346 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 IGKV1-13P0DP09 117 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 PAX6P26367 422 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 UCP3P55916 312 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 RIPPLY3P57055 190 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 UBA52P62987 128 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 CATR1Q13166 79 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 LSAMPQ13449 338 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 RTL8BQ17RB0 113 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 C16orf87Q6PH81 154 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF66Q6ZN08 573 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 OR4C16Q8NGL9 310 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 ZFAND1Q8TCF1 268 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 NABP2Q9BQ15 211 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF251Q9BRH9 671 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 TNFRSF19Q9NS68 423 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 GPR31O00270 319 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 CT45A6P0DMU7 189 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 CT45A5P0DMU8 189 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 CT45A7P0DMV0 189 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 IL7P13232 177 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM1-201ENST00000328020 PGAM2P15259 253 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms