RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	GSTT2B	P0CG30	244 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	GPR12	P47775	334 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	HERPUD1	Q15011	391 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	AP3S1	Q92572	193 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	GHITM	Q9H3K2	345 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	RDH8	Q9NYR8	311 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	ITGB1BP1	O14713	200 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	FGF16	O43320	207 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	OR3A3	P47888	321 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	RORC	P51449	518 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	ARPC4	P59998	168 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	LSAMP	Q13449	338 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	FBLN7	Q53RD9	439 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	IGSF11	Q5DX21	431 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059		Q8N2B8	174 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	CITED1	Q99966	193 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059		H7C2Y5	167 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059		M0QZ24	198 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	FBXO24	O75426	580 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	DIRAS3	O95661	229 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	MMD	Q15546	238 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	MZT2A	Q6P582	158 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	NABP2	Q9BQ15	211 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	OR2D2	Q9H210	308 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	IFT46	Q9NQC8	304 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	RNF150	Q9ULK6	438 aa		11.03	□□□□□ -0.64
CHID1-222	ENST00000533059	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	APOA2	P02652	100 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	TFAP2A	P05549	437 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	CTXN2	P0C2S0	81 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	SOX6	P35712	828 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	CBX5	P45973	191 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	ALDH3B2	P48448	385 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	CBX3	Q13185	183 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	EBI3	Q14213	229 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059		Q6ZS46	218 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059		Q6ZS49	121 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	ABCG5	Q9H222	651 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	KIAA1456	Q9P272	454 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	SCOC	Q9UIL1	159 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	FAM25A	B3EWG3	89 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	FAM25C	B3EWG5	89 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	FAM25G	B3EWG6	89 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059		M0R1X1	148 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	XRCC3	O43542	346 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	OR8U9	P0C7N5	309 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	TAS2R20	P59543	309 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	KRTAP10-3	P60369	221 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	PLGLA	Q15195	96 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	CTF1	Q16619	201 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	OR8U1	Q8NH10	309 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059		J3QRK9	145 aa		11	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	FCER2	P06734	321 aa		11	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	MC5R	P33032	325 aa		11	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	ACTB	P60709	375 aa		11	□□□□□ -0.65
CHID1-222	ENST00000533059	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		11	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms