RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 RNF150Q9ULK6 438 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 SERPINE3A8MV23 424 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 G3V4G9 280 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 TXNL1O43396 289 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 RAB6AP20340 208 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 CEACAM6P40199 344 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 GPR12P47775 334 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 IGSF11Q5DX21 431 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 LCNL1Q6ZST4 164 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 OR5H6Q8NGV6 325 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 PSMB11A5LHX3 300 aa14.79□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 PROP1O75360 226 aa14.79□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 RGS11O94810 467 aa14.79□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 IGHG2P01859 326 aa14.79□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 OPN1MWP04001 364 aa14.79□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 GSTT2P0CG29 244 aa14.79□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 GSTT2BP0CG30 244 aa14.79□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.79□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.79□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.79□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 AGMATQ9BSE5 352 aa14.79□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 ABCG5Q9H222 651 aa14.79□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 TRDCB7Z8K6 153 aa14.78□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 HSPA12AO43301 675 aa14.78□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 CT45A6P0DMU7 189 aa14.78□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 CT45A5P0DMU8 189 aa14.78□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 CT45A7P0DMV0 189 aa14.78□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 MMDQ15546 238 aa14.78□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.78□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 C5orf30Q96GV9 206 aa14.78□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 KCTD7Q96MP8 289 aa14.78□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TSTA3-211ENST00000529899 FABP7O15540 132 aa14.77□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 ACTBP60709 375 aa14.77□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 STPG2Q8N412 459 aa14.77□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.77□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 RDH8Q9NYR8 311 aa14.77□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 BET1O15155 118 aa14.76□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 ZBTB25P24278 435 aa14.76□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 ARFRP1Q13795 201 aa14.76□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 TPRA1Q86W33 373 aa14.76□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 TSPAN14Q8NG11 270 aa14.76□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.76□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 YIPF6Q96EC8 236 aa14.76□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.76□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM235A6NFC5 223 aa14.75□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 H0YJW9 148 aa14.75□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 RAB29O14966 203 aa14.75□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 CDNFQ49AH0 187 aa14.75□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.75□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 IDNKQ5T6J7 187 aa14.75□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.75□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.75□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 PTX4Q96A99 478 aa14.75□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 OR4F4Q96R69 305 aa14.75□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.75□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.75□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.75□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 SSX5O60225 188 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 SOX6P35712 828 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 ETV3LQ6ZN32 361 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF383Q8NA42 475 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 RHBDL2Q9NX52 303 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 AP4M1O00189 453 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 ITGB1BP1O14713 200 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 NBR2O15453 112 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 TNFAIP8O95379 198 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 PF4V1P10720 104 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 NDPQ00604 133 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 DUX3Q96PT4 197 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 A0A087WXM4 84 aa14.72□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.72□□□□□ -0.05
TSTA3-211ENST00000529899 G3V318 75 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms