RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa11.13□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 AGMATQ9BSE5 352 aa11.13□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 ABCG5Q9H222 651 aa11.13□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 MGAT4AQ9UM21 535 aa11.13□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 HSPA12AO43301 675 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 CD3GP09693 182 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 CD36P16671 472 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 ZBTB25P24278 435 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 SDC2P34741 201 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 TPRA1Q86W33 373 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 OR4F17Q8NGA8 305 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 OR8H1Q8NGG4 311 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 MAFIPQ8WZ33 124 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 PTX4Q96A99 478 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 KCTD7Q96MP8 289 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 OR4F4Q96R69 305 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 RASL11BQ9BPW5 248 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 ATG5Q9H1Y0 275 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 PIPOXQ9P0Z9 390 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 METTL21EPA6NDL7 271 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 G3V4G9 280 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 ITGB1BP1O14713 200 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 RAB29O14966 203 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 FABP7O15540 132 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 FCGR3AP08637 254 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 CT45A6P0DMU7 189 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 CT45A5P0DMU8 189 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 CT45A7P0DMV0 189 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 CNTFRP26992 372 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 ACTBP60709 375 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 MXD1Q05195 221 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 MMDQ15546 238 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM71F2Q6NXP2 309 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 SFXN4Q6P4A7 337 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 FOXRED2Q8IWF2 684 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 STPG2Q8N412 459 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 CHPT1Q8WUD6 406 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 HSPB9Q9BQS6 159 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 CENPOQ9BU64 300 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 RNF150Q9ULK6 438 aa11.11□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 PROP1O75360 226 aa11.1□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 GSTT2P0CG29 244 aa11.1□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 GSTT2BP0CG30 244 aa11.1□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 IGSF11Q5DX21 431 aa11.1□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM131AQ6UXB0 335 aa11.1□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 OR4A4PQ8NGN8 299 aa11.1□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 EDARADDQ8WWZ3 215 aa11.1□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 RDH8Q9NYR8 311 aa11.1□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 AP4M1O00189 453 aa11.09□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 BET1O15155 118 aa11.09□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 PF4V1P10720 104 aa11.09□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 SOX6P35712 828 aa11.09□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 LINC00205P59089 165 aa11.09□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 ARFRP1Q13795 201 aa11.09□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 CDNFQ49AH0 187 aa11.09□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 C18orf65Q6ZTR6 163 aa11.09□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 TSPAN14Q8NG11 270 aa11.09□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 LGALS14Q8TCE9 139 aa11.09□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 CABLES2Q9BTV7 478 aa11.09□□□□□ -0.63
PDGFRB-202ENST00000517488 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 A0A087WXM4 84 aa11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 H0YJW9 148 aa11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 NBR2O15453 112 aa11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 TGFBR1P36897 503 aa11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 TALDO1P37837 337 aa11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC35B1P78383 322 aa11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 KIR2DS1Q14954 304 aa11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 OXLD1Q5BKU9 147 aa11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 SAMD5Q5TGI4 173 aa11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 OR5H6Q8NGV6 325 aa11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 PHF21AQ96BD5 680 aa11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 TOLLIPQ9H0E2 274 aa11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 GHITMQ9H3K2 345 aa11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa11.07□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 TNFAIP8O95379 198 aa11.07□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 SERPINB10P48595 397 aa11.07□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa11.07□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 C5orf64Q2M2E5 130 aa11.07□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.07□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 IDNKQ5T6J7 187 aa11.07□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 HACD4Q5VWC8 232 aa11.07□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 LCNL1Q6ZST4 164 aa11.07□□□□□ -0.64
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF383Q8NA42 475 aa11.07□□□□□ -0.64
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