RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 NABP2Q9BQ15 211 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 CABLES2Q9BTV7 478 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 TOLLIPQ9H0E2 274 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 PLSCR3Q9NRY6 295 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 MGAM2Q2M2H8 2515 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 WNK1Q9H4A3 2382 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 M0QZ24 198 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 MOSP00540 346 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 IGSF11Q5DX21 431 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 HACD4Q5VWC8 232 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZS49 121 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 ABHD14BQ96IU4 210 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 PIPOXQ9P0Z9 390 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 RAB29O14966 203 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 PEX14O75381 377 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 CD28P10747 220 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 DTYMKP23919 212 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 TALDO1P37837 337 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 RPL39P5Q59GN2 51 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 FAM71F2Q6NXP2 309 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 CROCCP3Q8IVE0 287 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 EDARADDQ8WWZ3 215 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 GHITMQ9H3K2 345 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 RDH8Q9NYR8 311 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 SPATA2Q9UM82 520 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 TMEM235A6NFC5 223 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 DIRAS3O95661 229 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 CT45A6P0DMU7 189 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 CT45A5P0DMU8 189 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 CT45A7P0DMV0 189 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 SERPINB10P48595 397 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 F2RL1P55085 397 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 NCS1P62166 190 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 TREML4Q6UXN2 200 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 Q8N9W7 124 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 S1PR3Q99500 378 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 RNF150Q9ULK6 438 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 BET1O15155 118 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 SSX5O60225 188 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 PROP1O75360 226 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 FBXO24O75426 580 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 VBP1P61758 197 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 OR8H1Q8NGG4 311 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 RITA1Q96K30 269 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 TRAV18A0A075B6X5 111 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 PITPNAQ00169 270 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 OR5AU1Q8NGC0 362 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 OR10J5Q8NHC4 309 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A46Q96AG3 418 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 DCSTAMPQ9H295 470 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 A0A0A6YYH2 397 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 A6NJ64 397 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN15O95858 294 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 IGHG2P01859 326 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 GNG2P59768 71 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 C2orf68Q2NKX9 166 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 PHF21AQ96BD5 680 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 ABCG5Q9H222 651 aa16.58■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 LINC01548A6NM66 108 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 TFAP2AP05549 437 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 ALDH3B2P48448 385 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 C10orf99Q6UWK7 81 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 OR5AN1Q8NGI8 311 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 DIABLOQ9NR28 239 aa16.57■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 H0YJW9 148 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 GABARAPO95166 117 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 CSF1P09603 554 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 OR8U9P0C7N5 309 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 GPR12P47775 334 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 ACTBP60709 375 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 CD83Q01151 205 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 CTF1Q16619 201 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 FAM131AQ6UXB0 335 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 SLC35E3Q7Z769 313 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 OR8U1Q8NH10 309 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 RASL11BQ9BPW5 248 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 MMP27Q9H306 513 aa16.56■□□□□ 0.24
ACTB-211ENST00000480301 AUNIPQ9H7T9 357 aa16.56■□□□□ 0.24
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