RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	RAB29	O14966	203 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	GABARAP	O95166	117 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	DTYMK	P23919	212 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	RORC	P51449	518 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	CTF1	Q16619	201 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	C11orf88	Q6PI97	169 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZS46	218 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	RDH8	Q9NYR8	311 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902		A0A0A6YYH2	397 aa		14.16	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902		A6NJ64	397 aa		14.16	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902		M0QZK8	103 aa		14.16	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	CD1B	P29016	333 aa		14.16	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	14.16	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	HERPUD1	Q15011	391 aa		14.16	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	14.16	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		14.16	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		14.16	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	ZNF221	Q9UK13	617 aa		14.16	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		14.15	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	MOS	P00540	346 aa		14.15	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	GPR12	P47775	334 aa		14.15	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP10-3	P60369	221 aa		14.15	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	LSAMP	Q13449	338 aa		14.15	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	14.15	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		14.15	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		14.15	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		14.15	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	ABCG5	Q9H222	651 aa		14.15	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		14.15	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		14.15	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	14.15	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		14.15	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		14.14	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	ITGB1BP1	O14713	200 aa		14.14	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	SSX5	O60225	188 aa		14.14	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	EBI3	Q14213	229 aa		14.14	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		14.14	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902		Q8N2B8	174 aa		14.14	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		14.14	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	CITED1	Q99966	193 aa		14.14	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	NABP2	Q9BQ15	211 aa		14.14	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		14.14	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	GHITM	Q9H3K2	345 aa		14.14	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		14.14	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	XRCC3	O43542	346 aa		14.13	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	AMY1A	P04745	511 aa		14.13	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	AMY2A	P04746	511 aa		14.13	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	FCER2	P06734	321 aa		14.13	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	OR8U9	P0C7N5	309 aa		14.13	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	PTHLH	P12272	177 aa		14.13	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZS49	121 aa		14.13	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		14.13	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	OR8U1	Q8NH10	309 aa		14.13	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		14.13	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		14.13	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	SCOC	Q9UIL1	159 aa		14.13	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		14.12	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902		J3QRK9	145 aa		14.12	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	14.12	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	ARPC4	P59998	168 aa		14.12	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		14.12	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	MZT2A	Q6P582	158 aa		14.12	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	AP3S1	Q92572	193 aa		14.12	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	OR2D2	Q9H210	308 aa		14.12	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	14.12	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902		H7C2Y5	167 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	FGF16	O43320	207 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	HPGDS	O60760	199 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	DIRAS3	O95661	229 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	CTXN2	P0C2S0	81 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	TAS2R20	P59543	309 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	CNIH2	Q6PI25	160 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	BEST4	Q8NFU0	473 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		14.11	□□□□□ -0.15

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms