RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 NHSL1Q5SYE7 1610 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 ATP8B1O43520 1251 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 ADAP1O75689 374 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 ARL6IP5O75915 188 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-212ENST00000491302 AKR1C2P52895 323 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN31Q12999 210 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 MED21Q13503 144 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-212ENST00000491302 DOLPP1Q86YN1 238 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRC-212ENST00000491302 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
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PTPRC-212ENST00000491302 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
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PTPRC-212ENST00000491302 TP53I11O14683 189 aa3.75□□□□□ -1.81
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