RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM56	Q96MV1	263 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	OXGR1	Q96P68	337 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	NMES1	Q9C002	83 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	CHST6	Q9GZX3	395 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	CENPM	Q9NSP4	180 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	IFITM5	A6NNB3	132 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	VSTM5	A8MXK1	200 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495		B4DEV8	164 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB27B	O00194	218 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	VAMP5	O95183	116 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	CELA3B	P08861	270 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	CDK2	P24941	298 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	GLIPR1	P48060	266 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	SCAND1	P57086	179 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	TOMM40L	Q969M1	308 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM106A	Q96A25	262 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC22A	Q96IW7	307 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	CDH20	Q9HBT6	801 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	DUSP13	Q9UII6	198 aa		6.21	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	DAPL1	A0PJW8	107 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495		K7ERU9	68 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	NPIPB7	O75200	414 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFB2	O95178	105 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHG1	P01857	330 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	GTF2F2	P13984	249 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	CX3CR1	P49238	355 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	TGFBR3	Q03167	851 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	SCGB2A2	Q13296	93 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495		Q5PR19	223 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF738	Q8NE65	137 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	NAGK	Q9UJ70	344 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0A6YYH2	397 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	XKRY2	A2RUG3	117 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495		A6NJ64	397 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	C22orf46	C9J442	243 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	MSTN	O14793	375 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	CST4	P01036	141 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	CD1A	P06126	327 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2T7	P0C7T2	308 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	PGA4	P0DJD7	388 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	PGA5	P0DJD9	388 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM225B	P0DP42	221 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	ALDH3B1	P43353	468 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	OR3A2	P47893	321 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	ASCL1	P50553	236 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	CRMP1	Q14194	572 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	BATF	Q16520	125 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	MORN2	Q502X0	79 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	LYG2	Q86SG7	212 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	MITD1	Q8WV92	249 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	VPS13C	Q709C8	3753 aa		6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	LY6H	O94772	140 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	LYPD3	O95274	346 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	CD37	P11049	281 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	CTLA4	P16410	223 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM3A	P98173	230 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	ARL6IP1	Q15041	203 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	MIDN	Q504T8	468 aa		6.19	□□□□□ -1.42
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		6.19	□□□□□ -1.42

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