RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	MED10	Q9BTT4	135 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	IFT46	Q9NQC8	304 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	DIABLO	Q9NR28	239 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	DDIT4	Q9NX09	232 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	GMEB1	Q9Y692	573 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227		V9GYY9	64 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	PHLPP1	O60346	1717 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	PEAK1	Q9H792	1746 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	KIAA0556	O60303	1618 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	LRRC37A3	O60309	1634 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	MADD	Q8WXG6	1647 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	SLIT2	O94813	1529 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	MPDZ	O75970	2070 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	NCOA1	Q15788	1441 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	ALS2	Q96Q42	1657 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	UNC13B	O14795	1591 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	GLI2	P10070	1586 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	IQGAP2	Q13576	1575 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	LCT	P09848	1927 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	GRIN2B	Q13224	1484 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A1B0GTI1	187 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	FNDC10	F2Z333	226 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	GOLGA8R	I6L899	631 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227		M0QXV9	152 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	KDELR3	O43731	214 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC25A20	O43772	301 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	SCN2B	O60939	215 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	NIPSNAP2	O75323	286 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	LYPLA2	O95372	231 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	SNAP29	O95721	258 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	TNNC2	P02585	160 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	S100A6	P06703	90 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	GIMD1	P0DJR0	217 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	LIPC	P11150	499 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	CPM	P14384	443 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	GRPR	P30550	384 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	PSMD7	P51665	324 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	RAB25	P57735	213 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	OR2B6	P58173	313 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	RHOA	P61586	193 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227		Q6ZRU5	148 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	SSX6	Q7RTT6	188 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	SCX	Q7RTU7	201 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	LRRC6	Q86X45	466 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC25A45	Q8N413	288 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	ERMN	Q8TAM6	284 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	DOK4	Q8TEW6	326 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	GTF2H4	Q92759	462 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	TOP1MT	Q969P6	601 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	FMC1	Q96HJ9	113 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	CPB2	Q96IY4	423 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	VAT1	Q99536	393 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	ACBD6	Q9BR61	282 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31

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