RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 PTX4Q96A99 478 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM3DQ96BQ1 224 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 OR5M11Q96RB7 305 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 TAF9BQ9HBM6 251 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF286AQ9HBT8 521 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 C12orf4Q9NQ89 552 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 NDUFB11Q9NX14 153 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 GFOD1Q9NXC2 390 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 PIPOXQ9P0Z9 390 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA1456Q9P272 454 aa4.51□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF221Q9UK13 617 aa4.51□□□□□ -1.69
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CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa4.5□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa4.5□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa4.5□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM172BPA6NC97 362 aa4.5□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 LY6LH3BQJ8 138 aa4.5□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 AP4M1O00189 453 aa4.5□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 ITGB1BP1O14713 200 aa4.5□□□□□ -1.69
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CLSTN3-215ENST00000544584 ST8SIA5O15466 376 aa4.5□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 YPEL1O60688 119 aa4.5□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 RBBP9O75884 186 aa4.5□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 MMP23AO75900 390 aa4.5□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC22A5O76082 557 aa4.5□□□□□ -1.69
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CLSTN3-215ENST00000544584 ABCA11PQ4W5N1 156 aa4.5□□□□□ -1.69
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 TCF23Q7RTU1 214 aa4.5□□□□□ -1.69
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CLSTN3-215ENST00000544584 NRG4Q8WWG1 115 aa4.5□□□□□ -1.69
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CLSTN3-215ENST00000544584 TM2D1Q9BX74 207 aa4.5□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFP57Q9NU63 452 aa4.5□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 STUB1Q9UNE7 303 aa4.5□□□□□ -1.69
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CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM14DPA8MWL7 114 aa4.49□□□□□ -1.69
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CLSTN3-215ENST00000544584 C15orf65H3BRN8 121 aa4.49□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 PIN1P1O15428 100 aa4.49□□□□□ -1.69
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CLSTN3-215ENST00000544584 APOA2P02652 100 aa4.49□□□□□ -1.69
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CLSTN3-215ENST00000544584 CTXN2P0C2S0 81 aa4.49□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 CD37P11049 281 aa4.49□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 VDAC1P21796 283 aa4.49□□□□□ -1.69
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF137PP52743 207 aa4.49□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 LOXL3P58215 753 aa4.49□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 RPS25P62851 125 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 PLGLAQ15195 96 aa4.49□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 C2orf76Q3KRA6 126 aa4.49□□□□□ -1.69
CLSTN3-215ENST00000544584 KCTD21Q4G0X4 260 aa4.49□□□□□ -1.69
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