RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 FSTP19883 344 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 TPPP2P59282 170 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 CX3CL1P78423 397 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ASCL4Q6XD76 172 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 OR1L1Q8NH94 360 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 FCN1O00602 326 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 CDRT1O95170 752 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 PRR18Q8N4B5 295 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 NEK7Q8TDX7 302 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 NSL1Q96IY1 281 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 FBXL15Q9H469 300 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-201ENST00000404162 SHISA3A0PJX4 238 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 HBZP02008 142 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 ACTBL2Q562R1 376 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 OR4K15Q8NH41 348 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 OR52N1Q8NH53 320 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 PELI1Q96FA3 418 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 ING4Q9UNL4 249 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 GAB2Q9UQC2 676 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 J3QLW9 94 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 SLC16A6O15403 523 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 SPINT2O43291 252 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 DCTN3O75935 186 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF19P17023 458 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 TMED1Q13445 227 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 MORN2Q502X0 79 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 STEAP3Q658P3 488 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA24Q86W54 205 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 DAPL1A0PJW8 107 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 TRGV3P03979 118 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 ZP3P21754 424 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 GNMTQ14749 295 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 LCN12Q6JVE5 192 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 Q8N402 240 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 LFNGQ8NES3 379 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 C4orf36Q96KX1 117 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 J3QRE1 110 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 RRHO14718 337 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 MAGEB3O15480 346 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 CSN3P07498 182 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 RAB3AP20336 220 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 SYNJ2BPP57105 145 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 AKIRIN2Q53H80 203 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 KDM4DQ6B0I6 523 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF529Q6P280 563 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 OR52L2PQ8NGH6 319 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM106AQ96A25 262 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 RDH12Q96NR8 316 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 THTPAQ9BU02 230 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 METTL9Q9H1A3 318 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 RNF150Q9ULK6 438 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 DHDHQ9UQ10 334 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PP11 408 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINA2P20848 420 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 OR3A3P47888 321 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 CD81P60033 236 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD12-201ENST00000404162 MPV17LQ2QL34 196 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms