RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612509.4

SEMA3B-211, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,061 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-211ENST00000612509 UTF1Q5T230 341 aa14.61□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.61□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.61□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.61□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 IGLV1-47P01700 117 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 FUT3P21217 361 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 QRFPP83859 136 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 P2RY14Q15391 338 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 RAB11BQ15907 218 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 LTC4SQ16873 150 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 CYYR1Q96J86 154 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 TM2D1Q9BX74 207 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.6□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 A0A1B0GUS0 222 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 SHISA3A0PJX4 238 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 H3BUI4 141 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 MT-ND4P03905 459 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 GLAP06280 429 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 MYL9P24844 172 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 Q6ZSV7 163 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 GAPTQ8N292 157 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 OR9G1Q8NH87 305 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 RFESDQ8TAC1 157 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 PIFOQ8TCI5 191 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 CCDC107Q8WV48 283 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 NICN1Q9BSH3 213 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 ZNF747Q9BV97 191 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 BEX1Q9HBH7 125 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 TCF19Q9Y242 345 aa14.59□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 TENM1Q9UKZ4 2725 aa14.58□□□□□ -0.07
SEMA3B-211ENST00000612509 C15orf65H3BRN8 121 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 TOR1AO14656 332 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 CA11O75493 328 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 ARSBP15848 533 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 GALP22466 123 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 CHATP28329 748 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 DYNLT3P51808 116 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 MMP28Q9H239 520 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 RAB18Q9NP72 206 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 DPM3Q9P2X0 92 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 V9GY05 133 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 FBN3Q75N90 2809 aa14.58□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 A0A0A6YYD4 124 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 UBE2QL1A1L167 161 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 CLPSL1A2RUU4 121 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 POM121CA8CG34 1229 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 LEUTXA8MZ59 168 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 F2RL2O00254 374 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 PDCD5O14737 125 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 ORC5O43913 435 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 CHST1O43916 411 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 GZMHP20718 246 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 GNG10P50151 68 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 PRRX1P54821 245 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 CLDN12P56749 244 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 C6orf183Q5T699 404 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 C22orf42Q6IC83 251 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 OR4K15Q8NH41 348 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 UBALD1Q8TB05 177 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 WFDC12Q8WWY7 111 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 LEAP2Q969E1 77 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 ARL11Q969Q4 196 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 STUB1Q9UNE7 303 aa14.57□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 C12orf77C9JDV5 145 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 J3QR06 171 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 IGHV3-7P01780 117 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 RAB13P51153 203 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 PSMD7P51665 324 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 OR10A3P58181 314 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 NEDD8Q15843 81 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 HES5Q5TA89 166 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 OR51D1Q8NGF3 324 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 LINC01006Q8NI28 216 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 FAM3DQ96BQ1 224 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 LPAR5Q9H1C0 372 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 STEAP1Q9UHE8 339 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 PSG11Q9UQ72 335 aa14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 A6NDX4 124 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms