RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 HSPB6O14558 160 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 HSD17B6O14756 317 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 SLC35B1P78383 322 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 XAF1Q6GPH4 301 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 CDH26Q8IXH8 852 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 STPG2Q8N412 459 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 OR52N1Q8NH53 320 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 SMIM19Q96E16 107 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 GON7Q9BXV9 100 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 METTL9Q9H1A3 318 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 ABCG5Q9H222 651 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 ING3Q9NXR8 418 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-211ENST00000543190 STAB2Q8WWQ8 2551 aa14.71□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 IRGMA1A4Y4 181 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 AP4M1O00189 453 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 TXNL1O43396 289 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 IGKV1D-33P01593 117 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 IGKV1-33P01594 117 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 CD1BP29016 333 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 GPR176Q14439 515 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 ZNF329Q86UD4 541 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 RFESDQ8TAC1 157 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 DPF1Q92782 380 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 RAB9BQ9NP90 201 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 DNAH9Q9NYC9 4486 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 CA11O75493 328 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 CDRT1O95170 752 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 HTR3BO95264 441 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 FSTP19883 344 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 BDKRB2P30411 391 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 PPP3R1P63098 170 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 HES1Q14469 280 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 TEX38Q6PEX7 206 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 SATL1Q86VE3 508 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 ZNF485Q8NCK3 441 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 OR10K1Q8NGX5 313 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 LEAP2Q969E1 77 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 B9D2Q9BPU9 175 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 FAM90A10PA6NDY2 464 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 FAM90A7PA6NKC0 464 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 SERPINE3A8MV23 424 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 SC5DO75845 299 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 MT-ND4P03905 459 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 GLAP06280 429 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 GTF2F2P13984 249 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 SOX2P48431 317 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 ETV1P50549 477 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 RIPK1Q13546 671 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 DDI2Q5TDH0 399 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 ZNF695Q8IW36 515 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 Q8N9W7 124 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 S100A14Q9HCY8 104 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 ZNF581Q9P0T4 197 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 IGHV3-7P01780 117 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 GPR12P47775 334 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 GNG10P50151 68 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 FOXE3Q13461 319 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 LYPD6Q86Y78 171 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 ARL11Q969Q4 196 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms