RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 SLC2A1P11166 492 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 ATF1P18846 271 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 SRMP19623 302 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 GLRA1P23415 457 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 CD40LGP29965 261 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 ETV6P41212 452 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 INSL3P51460 131 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 PRKXP51817 358 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 FHL3Q13643 280 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 TAF13Q15543 124 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 BCL2L15Q5TBC7 163 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 SFXN4Q6P4A7 337 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 DEGS2Q6QHC5 323 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 TPRA1Q86W33 373 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 GPR148Q8TDV2 347 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 CHPT1Q8WUD6 406 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 PHYHIPQ92561 330 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 AP3S1Q92572 193 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 SGK3Q96BR1 496 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 CEP19Q96LK0 163 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 PBOV1Q9GZY1 135 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 BRD7Q9NPI1 651 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 COMMD3Q9UBI1 195 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 DAPK2Q9UIK4 370 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 V9GYH0 126 aa5.64□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 A0A0B4J203 849 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 RFPL4AA6NLU0 287 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 NOTOA8MTQ0 251 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 A8MZ25 164 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 TTRP02766 147 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 ISG15P05161 165 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 RAB3BP20337 219 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 HSD11B1P28845 292 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 GNALP38405 381 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 CX3CR1P49238 355 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 CAPZA1P52907 286 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 PPP5CP53041 499 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF45Q02386 682 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 MADCAM1Q13477 382 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF79Q15937 498 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 C9orf152Q5JTZ5 239 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 DDI2Q5TDH0 399 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 CNIH2Q6PI25 160 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 TCF23Q7RTU1 214 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 LRRTM1Q86UE6 522 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 CROCCP3Q8IVE0 287 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 ELMOD2Q8IZ81 293 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF561Q8N587 486 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 COMMD1Q8N668 190 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 DNAAF1Q8NEP3 725 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 OR5H6Q8NGV6 325 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 OR8U1Q8NH10 309 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 HPSE2Q8WWQ2 592 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 OR5P3Q8WZ94 311 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM106AQ96A25 262 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 MICU1Q9BPX6 476 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 RTL8AQ9BWD3 113 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF319Q9P2F9 582 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa5.63□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 HSPG2P98160 4391 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 A0A1B0GTI1 187 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 M0QZK8 103 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 PDCD5O14737 125 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 TBX1O43435 398 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 MAS1P04201 325 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF728P0DKX0 622 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 GP9P14770 177 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 SPNP16150 400 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 ELK1P19419 428 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 CFL1P23528 166 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 GSK3AP49840 483 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 GRB2P62993 217 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 PPP3R1P63098 170 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 SPANXN2Q5MJ10 180 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 HES5Q5TA89 166 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 MZT2AQ6P582 158 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 FAM57BQ71RH2 274 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 PRSS45Q7RTY3 260 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 Q8N1Y9 231 aa5.62□□□□□ -1.51
CASQ1-203ENST00000481081 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms