RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 PLXNA2O75051 1894 aa10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 DOCK11Q5JSL3 2073 aa10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 IL3RAP26951 378 aa10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 HTD2P86397 168 aa10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 FBXW9Q5XUX1 488 aa10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 TCF23Q7RTU1 214 aa10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 OR4B1Q8NGF8 309 aa10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM222Q9H0R3 208 aa10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 PLEK2Q9NYT0 353 aa10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 RRP8O43159 456 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 ADH1BP00325 375 aa10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 RPL19P84098 196 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 F6UZH7 168 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 CCL25O15444 150 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 PAGE4O60829 102 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 SSPNQ14714 243 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 FAM89BQ8N5H3 189 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 DDIT4LQ96D03 193 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 LIME1Q9H400 295 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 ST3GAL6Q9Y274 331 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 TNFSF14O43557 240 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 EGR1P18146 543 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 RBX1P62877 108 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 FUT7Q11130 342 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 C1orf61Q13536 156 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 Q6ZVH6 145 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 PSMF1Q92530 271 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 BORCS7Q96B45 105 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 BMFQ96LC9 184 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 IMMP2LQ96T52 175 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 RTN4RQ9BZR6 473 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF319Q9P2F9 582 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 CLDN16Q9Y5I7 305 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 RP1P56715 2156 aa10.65□□□□□ -0.7
SZRD1-201ENST00000401088 AQP7P3A6NL99 342 aa10.65□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 FCN1O00602 326 aa10.65□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 NXPH2O95156 264 aa10.65□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 CLDN1O95832 211 aa10.65□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa10.65□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 FAM58AQ8N1B3 248 aa10.65□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 D2HGDHQ8N465 521 aa10.65□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SGCZQ96LD1 299 aa10.65□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 LRRC3BQ96PB8 259 aa10.65□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 GPR35Q9HC97 309 aa10.65□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa10.65□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 NKX6-3A6NJ46 265 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SHISA8B8ZZ34 492 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 DEFB103AP81534 67 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 NSDHLQ15738 373 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 GAPTQ8N292 157 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 STPG4Q8N801 248 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 FGF14Q92915 247 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SLC7A10Q9NS82 523 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 RNF212BA8MTL3 300 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 CRYAAP02489 173 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SELENOTP62341 195 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 MFAP5Q13361 173 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 UBE2V1Q13404 147 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 LRTM2Q8N967 370 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 OR56B2PQ8NGI1 322 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 PP6455Q8WZ26 134 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 MED12Q93074 2177 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 B4DGG1 531 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF814B7Z6K7 855 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 NUPR1O60356 82 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SPINK4O60575 86 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SERF1AO75920 110 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 CDKN1AP38936 164 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 CDKN1BP46527 198 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 GRB2P62993 217 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 PIGYQ3MUY2 71 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 ATOH7Q8N100 152 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 WDYHV1Q96HA8 205 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 UNC13CQ8NB66 2214 aa10.64□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 CBLN1P23435 193 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 FFAR4Q5NUL3 377 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 CADM4Q8NFZ8 388 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 RAB40CQ96S21 281 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 KCNK17Q96T54 332 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 KLRF1Q9NZS2 232 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 CACNA1DQ01668 2161 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 LILRA1O75019 489 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms