RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 STPG3Q8N7X2 389 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 RNF152Q8N8N0 203 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 PSG11Q9UQ72 335 aa6.81□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 FUOMA2VDF0 154 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CCRL2O00421 344 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 SH2D1BO14796 132 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 PRKYO43930 277 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CST1P01037 141 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ELANEP08246 267 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ZNF44P15621 663 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 PRKACGP22612 351 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 RBP2P50120 134 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 GNG10P50151 68 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ATP1B3P54709 279 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CFHR3Q02985 330 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 MADCAM1Q13477 382 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 GK3PQ14409 553 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 Q6P435 159 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 Q8N6K4 173 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 Q8N9W7 124 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 OR11H1Q8NG94 326 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 RFT1Q96AA3 541 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ABCG5Q9H222 651 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 A0A1W2PPE3 182 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CSN2P05814 226 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 RAP2AP10114 183 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 SPNP16150 400 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 GLP1RP43220 463 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 REG1BP48304 166 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 RAB7AP51149 207 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 MTCP1P56278 107 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 SCN1BQ07699 218 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 EBI3Q14213 229 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 LTC4SQ16873 150 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 DHFR2Q86XF0 187 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 RDH10Q8IZV5 341 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 OR8H3Q8N146 312 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 TBX5Q99593 518 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 FAM107BQ9H098 131 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ZMAT4Q9H898 229 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 GNB4Q9HAV0 340 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CLN6Q9NWW5 311 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CALYQ9NYX4 217 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.79□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 HSPB6O14558 160 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 HSD17B6O14756 317 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 SNX3O60493 162 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 KDM4BO94953 1096 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CYB5AP00167 134 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 SERPINA3P01011 423 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 IL1AP01583 271 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 IGHG4P01861 327 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 KRT8P05787 483 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ATF1P18846 271 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 PSMB8P28062 276 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 KIR3DL2P43630 455 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 INSL3P51460 131 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 ACTR3P61158 418 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 GNB1P62873 340 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 BNIP1Q12981 228 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 CDK5R1Q15078 307 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.78□□□□□ -1.32
TTR-204ENST00000610404 MOB3BQ86TA1 216 aa6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms