RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	OR6C74	A6NCV1	312 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	GMDS	O60547	372 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	NIPSNAP2	O75323	286 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CNMD	O75829	334 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SEMA3D	O95025	777 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	GADD45G	O95257	159 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	DHFR	P00374	187 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	IFNA7	P01567	189 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	C1QB	P02746	253 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PSKH1	P11801	424 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CCL2	P13500	99 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	GPX2	P18283	190 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	MYL12A	P19105	171 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.18	□□□□□ -1.74	9e-7	■■■■□ 20
RBBP4-208	ENST00000463378	HTR2C	P28335	458 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	HOXA9	P31269	272 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PFN2	P35080	140 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TGFBR1	P36897	503 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CTRL	P40313	264 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CRAT	P43155	626 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	NMU	P48645	174 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	GZMM	P51124	257 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	P2RX1	P51575	399 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SELENOW	P63302	87 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PSPH	P78330	225 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC35B1	P78383	322 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF266	Q14584	549 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	GINS1	Q14691	196 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PSG5	Q15238	335 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CPTP	Q5TA50	214 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC34A3	Q8N130	599 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	NRTN	Q99748	197 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	NEU3	Q9UQ49	428 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ASB4	Q9Y574	426 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378		V9GYY9	64 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	MGAM	O43451	1857 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	MGAT4D	A6NG13	374 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	C5orf58	C9J3I9	102 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	OR1I1	O60431	355 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CDRT1	O95170	752 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PDYN	P01213	254 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PTH	P01270	115 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	GLA	P06280	429 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	C8G	P07360	202 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	RHOC	P08134	193 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	RAB3A	P20336	220 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TALDO1	P37837	337 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TAS2R60	P59551	318 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	HES5	Q5TA89	166 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	STPG2	Q8N412	459 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00471	Q8N535	108 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	RDH5	Q92781	318 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	KCTD7	Q96MP8	289 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBBP4-208	ENST00000463378	HBEGF	Q99075	208 aa		4.17	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms