RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 FAM157AC9JC47 383 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 J3QT63 122 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 NDUFA2O43678 99 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 ARHGDIBP52566 201 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 FAM58AQ8N1B3 248 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 DEFB124Q8NES8 71 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 HIPK2Q9H2X6 1198 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 MLXQ9UH92 298 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 IL17BQ9UHF5 180 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 PTPRBP23467 1997 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 MUC6Q6W4X9 2439 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 LMO1P25800 156 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 CD82P27701 267 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 RFC3P40938 356 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 CAMLGP49069 296 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 PRSS12P56730 875 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 VAMP2P63027 116 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 ID3Q02535 119 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 NMSQ5H8A3 153 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 SPIN3Q5JUX0 258 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 TMEM178AQ8NBL3 297 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 OR10Z1Q8NGY1 313 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 NEK7Q8TDX7 302 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 AKR1E2Q96JD6 320 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 RTL8AQ9BWD3 113 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 SMIM3Q9BZL3 60 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 TUBA4BQ9H853 241 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 C19orf12Q9NSK7 152 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 A0A1B0GU03 582 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 NKX2-6A6NCS4 301 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 SELEP16581 610 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 CD80P33681 288 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 HLA-DRB3P79483 266 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 TGFBR3Q03167 851 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 DPPA3Q6W0C5 159 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 SUMF2Q8NBJ7 301 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 NAXEQ8NCW5 288 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 PRSS33Q8NF86 280 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 OR51I2Q9H344 312 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 WFDC1Q9HC57 220 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 OR2W1Q9Y3N9 320 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 SCTP09683 121 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 FTH1P19P0C7X4 201 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 FOLR2P14207 255 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 PRKACAP17612 351 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 TUBG1P23258 451 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 CD200P41217 278 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 LINC00696Q6ZRV3 163 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 GAPTQ8N292 157 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 C15orf54Q8N8G6 183 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 OR10J5Q8NHC4 309 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 HES7Q9BYE0 225 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 TUBG2Q9NRH3 451 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 FAM96BQ9Y3D0 163 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 SIGLEC5O15389 551 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 NGFP01138 241 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 OR8U9P0C7N5 309 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 F2RP25116 425 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 NPBWR1P48145 328 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 HERPUD1Q15011 391 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 PDCD1Q15116 288 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 GABRA6Q16445 453 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 GUK1Q16774 197 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 MIDNQ504T8 468 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 C9orf135Q5VTT2 229 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 PCSK4Q6UW60 755 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 OR8U1Q8NH10 309 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 WDYHV1Q96HA8 205 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 PLA2G3Q9NZ20 509 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 DFFBO76075 338 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 PRH1P02810 166 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 CEACAM1P13688 526 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-203ENST00000402697 AVPI1Q5T686 147 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms