RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr46Q8VGJ4 318 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lingo1Q9D1T0 614 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Suv39h2Q9EQQ0 477 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cx3cr1Q9Z0D9 354 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mecp2Q9Z2D6 484 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atxn7l3A2AWT3 347 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r167G3UW71 315 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Efna4O08542 206 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifi203O35368 408 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ntsr1O88319 424 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tex30Q3TUU5 225 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nkain3Q3URJ8 181 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 6430531B16RikQ3V2J1 307 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnase12Q5GAM8 145 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PmelQ60696 626 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr11Q60890 313 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1212Q7TR08 311 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam234bQ8BYI8 624 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam25cQ8CF02 89 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CenpoQ8K015 298 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1201Q8VGF5 307 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Serpinb1bQ8VHP7 382 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pla1aQ8VI78 456 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snu13Q9D0T1 128 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Asb12Q9D738 308 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Emc9Q9DB76 206 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mmp1aQ9EPL5 464 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tsga8Q9JJL0 238 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sema7aQ9QUR8 664 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sp100O35892 482 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PipP02816 146 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700057G04RikQ3V0U0 232 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DhhQ61488 396 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ArhgdibQ61599 200 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sema6dQ76KF0 1073 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nmnat2Q8BNJ3 307 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rell2Q8BRJ3 303 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CenpxQ8C4X1 78 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Esco2Q8CIB9 592 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf113a1Q8R3P8 341 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr994Q8VF73 314 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr803Q8VFI3 308 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ms4a4dQ99N05 225 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Carhsp1Q9CR86 148 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700020A23RikQ9DA59 131 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NmuQ9QXK8 174 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr785A0A0N4SVC3 312 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ly6g6fB2RXM6 300 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klk1b1P00755 261 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp27P10077 819 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd1d1P11609 336 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd1d2P11610 336 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PtgfrP43117 366 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Irgm1Q60766 409 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prss43Q76HL1 382 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vgll4Q80V24 287 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdk3Q80YP0 303 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8BR90 294 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NaxeQ8K4Z3 282 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 B4galt7Q8R087 327 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrpl21Q9D1N9 209 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 9230110F15RikQ9D262 117 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cir1Q9DA19 450 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Iqcf5Q9DAL7 148 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2610044O15Rik8A0A087WRJ1 410 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv12-89A0A0G2JGW8 112 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr685A0A1L1SVG7 331 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5458L7N219 204 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P2rx6O54803 389 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccr2P51683 373 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyb5aP56395 134 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 S100a1P56565 94 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr173Q6PI62 373 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr804Q7TRH7 314 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prrg4Q8BGN6 226 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Exosc6Q8BTW3 273 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Inpp5kQ8C5L6 468 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr777Q8VFH3 311 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1233Q8VGN0 305 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sgo1Q9CXH7 517 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spsb1Q9D5L7 273 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IcaQ9DBD0 700 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ackr1Q9QUI6 334 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Naa10Q9QY36 235 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dmxl1Q6PNC0 3013 aa18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mptx2D3YYJ7 219 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C3ar1O09047 477 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fkbp8O35465 402 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igk-V19-17P01633 149 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cxcl2P10889 100 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rab18P35293 206 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hist1h1dP43277 221 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd7P50283 210 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gnb3Q61011 340 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hes3Q61657 175 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Orm3Q63805 206 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Asphd2Q80VP9 343 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1309Q8VF83 320 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1301Q8VGE7 312 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atg12Q9CQY1 141 aa18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.2 ms