Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA59

1700020A23Rik, MCG9903, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700020A23RikQ9DA59 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
1700020A23RikQ9DA59 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
1700020A23RikQ9DA59 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
1700020A23RikQ9DA59 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
1700020A23RikQ9DA59 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
1700020A23RikQ9DA59 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
1700020A23RikQ9DA59 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
1700020A23RikQ9DA59 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
1700020A23RikQ9DA59 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
1700020A23RikQ9DA59 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
1700020A23RikQ9DA59 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
1700020A23RikQ9DA59 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700020A23RikQ9DA59 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
1700020A23RikQ9DA59 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
1700020A23RikQ9DA59 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
1700020A23RikQ9DA59 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
1700020A23RikQ9DA59 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700020A23RikQ9DA59 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
1700020A23RikQ9DA59 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700020A23RikQ9DA59 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700020A23RikQ9DA59 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
1700020A23RikQ9DA59 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700020A23RikQ9DA59 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
1700020A23RikQ9DA59 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
1700020A23RikQ9DA59 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
1700020A23RikQ9DA59 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700020A23RikQ9DA59 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700020A23RikQ9DA59 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
1700020A23RikQ9DA59 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
1700020A23RikQ9DA59 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
1700020A23RikQ9DA59 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
1700020A23RikQ9DA59 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700020A23RikQ9DA59 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
1700020A23RikQ9DA59 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700020A23RikQ9DA59 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
1700020A23RikQ9DA59 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
1700020A23RikQ9DA59 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
1700020A23RikQ9DA59 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
1700020A23RikQ9DA59 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
1700020A23RikQ9DA59 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
1700020A23RikQ9DA59 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
1700020A23RikQ9DA59 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
1700020A23RikQ9DA59 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
1700020A23RikQ9DA59 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
1700020A23RikQ9DA59 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
1700020A23RikQ9DA59 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
1700020A23RikQ9DA59 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
1700020A23RikQ9DA59 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700020A23RikQ9DA59 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
1700020A23RikQ9DA59 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700020A23RikQ9DA59 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700020A23RikQ9DA59 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700020A23RikQ9DA59 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700020A23RikQ9DA59 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700020A23RikQ9DA59 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
1700020A23RikQ9DA59 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
1700020A23RikQ9DA59 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
1700020A23RikQ9DA59 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
1700020A23RikQ9DA59 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700020A23RikQ9DA59 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
1700020A23RikQ9DA59 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
1700020A23RikQ9DA59 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
1700020A23RikQ9DA59 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700020A23RikQ9DA59 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700020A23RikQ9DA59 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700020A23RikQ9DA59 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700020A23RikQ9DA59 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700020A23RikQ9DA59 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700020A23RikQ9DA59 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700020A23RikQ9DA59 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700020A23RikQ9DA59 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700020A23RikQ9DA59 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
1700020A23RikQ9DA59 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700020A23RikQ9DA59 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700020A23RikQ9DA59 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700020A23RikQ9DA59 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700020A23RikQ9DA59 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
1700020A23RikQ9DA59 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700020A23RikQ9DA59 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700020A23RikQ9DA59 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700020A23RikQ9DA59 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700020A23RikQ9DA59 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700020A23RikQ9DA59 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
1700020A23RikQ9DA59 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700020A23RikQ9DA59 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700020A23RikQ9DA59 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
1700020A23RikQ9DA59 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
1700020A23RikQ9DA59 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
1700020A23RikQ9DA59 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700020A23RikQ9DA59 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700020A23RikQ9DA59 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700020A23RikQ9DA59 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700020A23RikQ9DA59 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700020A23RikQ9DA59 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700020A23RikQ9DA59 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700020A23RikQ9DA59 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700020A23RikQ9DA59 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700020A23RikQ9DA59 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700020A23RikQ9DA59 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700020A23RikQ9DA59 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms