Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,34■■■■□ 3,25
Igk-V19-17P01633 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Igk-V19-17P01633 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Igk-V19-17P01633 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,94■■■□□ 2,54
Igk-V19-17P01633 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,61■■■□□ 2,49
Igk-V19-17P01633 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Igk-V19-17P01633 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
Igk-V19-17P01633 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Igk-V19-17P01633 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Igk-V19-17P01633 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Igk-V19-17P01633 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Igk-V19-17P01633 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,55■■■□□ 2,32
Igk-V19-17P01633 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Igk-V19-17P01633 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Igk-V19-17P01633 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Igk-V19-17P01633 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Igk-V19-17P01633 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
Igk-V19-17P01633 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Igk-V19-17P01633 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Igk-V19-17P01633 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Igk-V19-17P01633 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Igk-V19-17P01633 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Igk-V19-17P01633 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Igk-V19-17P01633 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Igk-V19-17P01633 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Igk-V19-17P01633 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Igk-V19-17P01633 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Igk-V19-17P01633 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Igk-V19-17P01633 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Igk-V19-17P01633 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Igk-V19-17P01633 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Igk-V19-17P01633 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Igk-V19-17P01633 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
Igk-V19-17P01633 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Igk-V19-17P01633 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Igk-V19-17P01633 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Igk-V19-17P01633 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Igk-V19-17P01633 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Igk-V19-17P01633 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Igk-V19-17P01633 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Igk-V19-17P01633 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Igk-V19-17P01633 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Igk-V19-17P01633 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Igk-V19-17P01633 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Igk-V19-17P01633 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Igk-V19-17P01633 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Igk-V19-17P01633 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Igk-V19-17P01633 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Igk-V19-17P01633 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Igk-V19-17P01633 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Igk-V19-17P01633 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Igk-V19-17P01633 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Igk-V19-17P01633 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Igk-V19-17P01633 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Igk-V19-17P01633 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Igk-V19-17P01633 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Igk-V19-17P01633 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Igk-V19-17P01633 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,71■■□□□ 1,87
Igk-V19-17P01633 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Igk-V19-17P01633 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,63■■□□□ 1,85
Igk-V19-17P01633 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Igk-V19-17P01633 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Igk-V19-17P01633 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Igk-V19-17P01633 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Igk-V19-17P01633 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Igk-V19-17P01633 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Igk-V19-17P01633 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Igk-V19-17P01633 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Igk-V19-17P01633 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Igk-V19-17P01633 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Igk-V19-17P01633 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Igk-V19-17P01633 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Igk-V19-17P01633 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Igk-V19-17P01633 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,33■■□□□ 1,81
Igk-V19-17P01633 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Igk-V19-17P01633 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Igk-V19-17P01633 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,28■■□□□ 1,8
Igk-V19-17P01633 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Igk-V19-17P01633 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Igk-V19-17P01633 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Igk-V19-17P01633 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Igk-V19-17P01633 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Igk-V19-17P01633 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Igk-V19-17P01633 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Igk-V19-17P01633 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Igk-V19-17P01633 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Igk-V19-17P01633 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Igk-V19-17P01633 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Igk-V19-17P01633 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Igk-V19-17P01633 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,02■■□□□ 1,76
Igk-V19-17P01633 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,02■■□□□ 1,76
Igk-V19-17P01633 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Igk-V19-17P01633 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Igk-V19-17P01633 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Igk-V19-17P01633 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Igk-V19-17P01633 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Igk-V19-17P01633 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Igk-V19-17P01633 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Igk-V19-17P01633 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Igk-V19-17P01633 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms