RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466498.2

LAMTOR4-204, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, human

TSL 2

Gene LAMTOR4, Length 371 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LAMTOR4-204	ENST00000466498	OR4C12	Q96R67	309 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	S1PR3	Q99500	378 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	LINC01619	G3V211	115 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	HSPA12A	O43301	675 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	CSN2	P05814	226 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	ZNF44	P15621	663 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	SOX6	P35712	828 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	KIR3DL2	P43630	455 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	REG1B	P48304	166 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	SCN1B	Q07699	218 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	LTC4S	Q16873	150 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	CGB2	Q6NT52	195 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	HMG20A	Q9NP66	347 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	KRT84	Q9NSB2	600 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	ZNF580	Q9UK33	172 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	COPS3	Q9UNS2	423 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498		R4GMQ9	66 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	MUC4	Q99102	2169 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	CNTFR	P26992	372 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	GLP1R	P43220	463 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	ATP1B3	P54709	279 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	PITPNA	Q00169	270 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	MICA	Q29983	383 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	RETN	Q9HD89	108 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	CALY	Q9NYX4	217 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	KIAA1456	Q9P272	454 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		11.1	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	MOS	P00540	346 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	SERPINA3	P01011	423 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	CGB3	P0DN86	165 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	CGB7	P0DN87	165 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	CCL1	P22362	96 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	SLC2A5	P22732	501 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	RBP2	P50120	134 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	APOF	Q13790	326 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	ODF4	Q2M2E3	257 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	CHST5	Q9GZS9	411 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LAMTOR4-204	ENST00000466498		A0A1W2PPE3	182 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	ARPC2	O15144	300 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	IL1A	P01583	271 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	IGLV1-40	P01703	118 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	RAB9A	P51151	201 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	ACTR3	P61158	418 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	GINS1	Q14691	196 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	APOL4	Q9BPW4	351 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	TUBA4B	Q9H853	241 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498		A0A087WW49	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498		G3V318	75 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	SYT7	O43581	403 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	HMGN1	P05114	100 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	CD1B	P29016	333 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	F2RL1	P55085	397 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	MTCP1	P56278	107 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498		Q6P435	159 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	CHST4	Q8NCG5	386 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		11.07	□□□□□ -0.64
LAMTOR4-204	ENST00000466498	RFESD	Q8TAC1	157 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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