RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W CPR7P47103 393 aa10.69□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W VMA10P48836 114 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W BCP1Q06338 283 aa10.69□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W RRT12P25381 491 aa10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W IRE1P32361 1115 aa10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W ETR1P38071 380 aa10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W DYS1P38791 387 aa10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W STL1P39932 569 aa10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W ARG2P40360 574 aa10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W MPH1P40562 993 aa10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W YJL107CP42947 387 aa10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W NUT1P53114 1132 aa10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W YGR016WP53209 190 aa10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W TAM41P53230 385 aa10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W BIO4P53630 237 aa10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W ADE13Q05911 482 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W ADY3Q07732 790 aa10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W MDM20Q12387 796 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W BI2P03873 423 aa10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W BI4P03879 638 aa10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W RNR1P21524 888 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W URA7P28274 579 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W DGR2P32330 852 aa10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W PEX2P32800 271 aa10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W MRP8P35719 219 aa10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W YKR015CP36111 568 aa10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W APM2P38700 605 aa10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W NUP60P39705 539 aa10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W TMN3P40071 706 aa10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W LIF1P53150 421 aa10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W NSE1Q07913 336 aa10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W MET7Q08645 548 aa10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W YIG1Q08956 461 aa10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W IES3Q12345 250 aa10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W BI3Q9ZZW7 517 aa10.67□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data10.66□□□□□ -0.7not detected
PRP4YPR178W STE6P12866 1290 aa10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W SEC63P14906 663 aa10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W CDC48P25694 835 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W KAR9P32526 644 aa10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W SIP2P34164 415 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W ATG19P35193 415 aa10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W TGL4P36165 910 aa10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W NPP2P39997 493 aa10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W TMA108P40462 946 aa10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W MRM2P53123 320 aa10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W NMA2P53204 395 aa10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W ULP1Q02724 621 aa10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W YDR476CQ03362 224 aa10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W YPR097WQ06839 1073 aa10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W YET3Q07451 203 aa10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W VIK1Q12045 647 aa10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W MSH5Q12175 901 aa10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W PMA1P05030 918 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W EST1P17214 699 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data10.65□□□□□ -0.7 RIP-Chip
PRP4YPR178W RAD14P28519 371 aa10.65□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W BCK2P33306 851 aa10.65□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W ERC1P38767 581 aa10.65□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W FTR1P40088 404 aa10.65□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W HSH155P49955 971 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W SLT2Q00772 484 aa10.65□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W TBF1Q02457 562 aa10.65□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W THI7Q05998 598 aa10.65□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W DUS4Q06063 367 aa10.65□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W YPR202WQ08993 238 aa10.65□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa10.65□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W PRT1P06103 763 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W MSD1P15179 658 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W CDC42P19073 191 aa10.65□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SNT1P25357 1226 aa10.65□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W GYP6P32806 458 aa10.65□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W NPL6P32832 435 aa10.65□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W VHR2P40041 505 aa10.65□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W MAM33P40513 266 aa10.65□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W MKT1P40850 830 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W YJL045WP47052 634 aa10.65□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W TMA20P89886 181 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W BUD22Q04347 519 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W SBP1P10080 294 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W PDC5P16467 563 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W DPB2P24482 689 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W TMT1P32643 299 aa10.64□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W FAR3P46671 204 aa10.64□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W NOP9P47077 666 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W RTA1P53047 317 aa10.64□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W YGR125WP53273 1036 aa10.64□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W RCF2P53721 224 aa10.64□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W CRD1Q07560 283 aa10.64□□□□□ -0.71
PRP4YPR178W IOC2Q12072 812 aa10.64□□□□□ -0.71
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