RNA–Protein interactions for RNA: YMR135W-A

YMR135W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YMR135W-A, Length 534 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR135W-AYMR135W-A NFI1Q12216 726 aa5.9□□□□□ -1.46
YMR135W-AYMR135W-A YBR182C-AQ8TGU6 64 aa5.9□□□□□ -1.46
YMR135W-AYMR135W-A CPA2P03965 1118 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A CDC4P07834 779 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A MIS1P09440 975 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A SIR1P21691 654 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YCL002CP25565 263 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A POL4P25615 582 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YKR018CP36114 725 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A FTH1P38310 465 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A SSP120P39931 234 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A GDI1P39958 451 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YER158CP40095 573 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A PCL7P40186 285 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A AIR1P40507 360 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A AAD14P42884 376 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A CIT3P43635 486 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A VTC4P47075 721 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A MDE1P47095 244 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A PSP2P50109 593 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YML119WQ03208 357 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YLH47Q06493 454 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A APL5Q08951 932 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A ZRT2Q12436 422 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A RPC40P07703 335 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A HSF1P10961 833 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A GLN4P13188 809 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A BET2P20133 325 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A SRO9P25567 434 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A GPI10P30777 616 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A KNS1P32350 737 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A DEF1P35732 738 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A TAF5P38129 798 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A QNS1P38795 714 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A PIK1P39104 1066 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A NPP2P39997 493 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A PRM2P40534 656 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A NUP85P46673 744 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A FYV8P46949 817 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YJR039WP47107 1121 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A GCV1P48015 400 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A PIL1P53252 339 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A BSC5P53755 489 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A VPS75P53853 264 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A NSI1Q12457 570 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A ARG82P07250 355 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YEL076C-AP0CX16 216 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YLR464WP0CX17 216 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A POL3P15436 1097 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data5.87□□□□□ -1.47not detected
YMR135W-AYMR135W-A STE50P25344 346 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A ADK2P26364 225 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A IME2P32581 645 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A TEF4P36008 412 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A SET3P36124 751 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A MRPL36P36531 177 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A REI1P38344 393 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A VPS41P38959 992 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A BEM4P39011 633 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A TIF4631P39935 952 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YEL076CP39971 216 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YEL025CP39991 1188 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A RTT105P40063 208 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A NEO1P40527 1151 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A DUO1P53168 247 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A NOP15P53927 220 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A RPT6Q01939 405 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A ARP9Q05123 467 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YPL277CQ08989 487 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A MET32Q12041 191 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A PDH1Q12428 516 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A Q0142Q9ZZW4 58 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A DNA2P38859 1522 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A TUF1P02992 437 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YCK2P23292 546 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A LCB1P25045 558 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A RRP7P25368 297 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A RIB7P33312 244 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A UIP5P36137 443 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A SPO22P40511 975 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A MAD2P40958 196 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A LCB2P40970 561 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YFL052WP43551 465 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A SIP4P46954 829 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A PSP1P50896 841 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A SGF73P53165 657 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A HST1P53685 503 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YNR061CP53747 219 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A CRR1Q05790 422 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A SKM1Q12469 655 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A PCD1Q12524 340 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A YLR149CQ99296 730 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR135W-AYMR135W-A RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.4 ms