RNA–Protein interactions for RNA: YJL173C

RFA3, Transcript of Subunit of heterotrimeric Replication Protein A (RPA), yeast

Gene RFA3, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFA3	YJL173C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	SEC65	P29478	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	DID4	P36108	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	GLG1	P36143	616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	BIT61	P47041	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	DUN1	P39009	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	YIL077C	P40508	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	YPS7	Q06325	596 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	NTH1	P32356	751 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	TDP1	P38319	544 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	HXT7	P39004	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	BDH2	P39713	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	PXA1	P41909	870 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	PPN1	Q04119	674 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	SEC6	P32844	805 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	OAF3	P36023	863 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	COS111	P38308	924 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	UBP12	P39538	1254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	MPS3	P47069	682 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	RFX1	P48743	811 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	YGR151C	P53287	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	TAF3	Q12297	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	YEN1	P40028	759 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	YFT2	Q06676	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	HFI1	Q12060	488 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
RFA3	YJL173C	APM4	Q99186	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	IME1	P21190	360 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	FUB1	P25659	250 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	YPT7	P32939	208 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	SET3	P36124	751 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	BUD8	P41698	603 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	STP4	Q07351	490 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	GMH1	P36125	273 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	CTP1	P38152	299 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	KHA1	P40309	873 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	YIL166C	P40445	542 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	TAF4	P50105	388 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	SPO1	P53541	631 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	RMP1	Q12530	201 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	TSR4	P25040	408 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	KCC4	P25389	1037 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	GRX4	P32642	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	APL3	P38065	1025 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	FAT1	P38225	669 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	UBS1	P38290	277 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	VID28	P40547	921 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	IES1	P43579	692 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	TAH11	P47112	604 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	SPC98	P53540	846 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	NMA2	P53204	395 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	NSE5	Q03718	556 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	TRE2	Q08693	809 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	RPN13	O13563	156 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	SPO11	P23179	398 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	PPZ2	P33329	710 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	DIP5	P53388	608 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	SUT2	Q12286	268 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	PRE4	P30657	266 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	DGR2	P32330	852 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	YHR033W	P38690	423 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	RKI1	Q12189	258 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RFA3	YJL173C	CDC26	P14724	124 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RFA3	YJL173C	AEP2	P22136	580 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RFA3	YJL173C	DAL3	P32459	195 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RFA3	YJL173C	EUG1	P32474	517 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RFA3	YJL173C	ELF1	P36053	145 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RFA3	YJL173C	TMN3	P40071	706 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RFA3	YJL173C	FDC1	Q03034	503 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RFA3	YJL173C	SKY1	Q03656	742 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RFA3	YJL173C	UFO1	Q04511	668 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RFA3	YJL173C	IZH3	Q07959	543 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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