RNA–Protein interactions for RNA: YGL009C

LEU1, Transcript of Isopropylmalate isomerase, yeast

Gene LEU1, Length 2,340 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LEU1	YGL009C	PCL10	P53124	433 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	LSB1	P53281	241 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	HST1	P53685	503 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	CAF120	P53836	1060 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	YML119W	Q03208	357 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	SKY1	Q03656	742 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	UFO1	Q04511	668 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	GAD1	Q04792	585 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	ADY3	Q07732	790 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	PEX15	Q08215	383 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	MET7	Q08645	548 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	IQG1	Q12280	1495 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	STF1	P01098	86 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	HSF1	P10961	833 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	RPC53	P25441	422 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	CCL1	P37366	393 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	UBP13	P38187	747 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	UBP15	P50101	1230 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	CIA1	Q05583	330 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	ENV7	Q12003	364 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	ENA1	P13587	1091 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	PHO81	P17442	1178 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	CBP3	P21560	335 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	RSC6	P25632	483 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
LEU1	YGL009C	YLF2	P38746	405 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	JJJ1	P53863	590 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	ENA2	Q01896	1091 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	TDA9	Q04545	1251 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	YDL073W	Q07454	984 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	YOR352W	Q08816	343 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	ENA5	Q12691	1091 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	MET8	P15807	274 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	BEM3	P32873	1128 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	MRPL16	P38064	232 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	PEX32	P38292	413 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	HXT7	P39004	570 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	YJR098C	P47139	656 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	SHE4	P51534	789 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	NUP84	P52891	726 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	YGR266W	P53326	701 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	GTR1	Q00582	310 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	MEC3	Q02574	474 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	MMS1	Q06211	1407 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	CDC4	P07834	779 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	PKP1	P40530	394 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	YNR063W	P53749	607 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	MCP2	Q06567	569 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	YPL260W	Q08977	551 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	APM4	Q99186	491 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	ATG14	P38270	344 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	SPO74	P45819	413 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	GUP1	P53154	560 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
LEU1	YGL009C	MHP1	P43638	1398 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	MRP10	O75012	95 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	ITR1	P30605	584 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	YKL151C	P36059	337 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	UBS1	P38290	277 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	VPS53	P47061	822 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	NHX1	Q04121	633 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	YLR287C	Q05881	355 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
LEU1	YGL009C	HFI1	Q12060	488 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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