RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W YGR151CP53287 111 aa4.25□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W THI22Q06490 572 aa4.25□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W GIN4Q12263 1142 aa4.25□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W SET2P46995 733 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W NET1P47035 1189 aa4.24□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W SPC98P53540 846 aa4.24□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W ATG33Q06485 197 aa4.24□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W GUD1Q07729 489 aa4.24□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W YLR001CQ07895 862 aa4.24□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W ECM3Q99252 613 aa4.24□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W PCM1P38628 557 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W PMT3P47190 753 aa4.23□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W AIM14P53109 570 aa4.23□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W YGL081WP53156 320 aa4.23□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W ARP4P80428 489 aa4.23□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W YDL086WQ07505 273 aa4.23□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W RGT2Q12300 763 aa4.23□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W HMG1P12683 1054 aa4.22□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W SEC6P32844 805 aa4.22□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W MGS1P40151 587 aa4.22□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W MET13P53128 600 aa4.22□□□□□ -1.73
NSE4YDL105W SAT4P25333 603 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W YMC2P38087 329 aa4.21□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W CTP1P38152 299 aa4.21□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W YNL195CP40168 261 aa4.21□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W FMP30Q02883 468 aa4.21□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W THI73Q07904 523 aa4.21□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W NUP145P49687 1317 aa4.21□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W PGK1P00560 416 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W ERG11P10614 530 aa4.2□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W STE12P13574 688 aa4.2□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W NTH1P32356 751 aa4.2□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W UGP1P32861 499 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W APL3P38065 1025 aa4.2□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W MPS3P47069 682 aa4.2□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W BRE5P53741 515 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W FEN2P25621 512 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W MNN4P36044 1178 aa4.19□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W STB2P46679 850 aa4.19□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W BFA1P47113 574 aa4.19□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W MPS1P54199 764 aa4.19□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W POM34Q12445 299 aa4.19□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W PHO5P00635 467 aa4.18□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W ERG20P08524 352 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data4.18□□□□□ -1.74not detected
NSE4YDL105W TYS1P36421 394 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W CKB2P38930 258 aa4.18□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W MIT1P40002 666 aa4.18□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W KHA1P40309 873 aa4.18□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W XBP1P40489 647 aa4.18□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W YJR039WP47107 1121 aa4.18□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W RFX1P48743 811 aa4.18□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W NMA2P53204 395 aa4.18□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W UME1Q03010 460 aa4.18□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W LAM4P38800 1345 aa4.18□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W SEC15P22224 910 aa4.17□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W PRP19P32523 503 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W MAL31P38156 614 aa4.17□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W YIL077CP40508 320 aa4.17□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W BPL1P48445 690 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W YGR237CP50089 785 aa4.17□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W RKI1Q12189 258 aa4.17□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W MDM20Q12387 796 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W KIN82P25341 720 aa4.16□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W YMC1P32331 307 aa4.16□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W YKR075CP36155 307 aa4.16□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W TDA3P38758 523 aa4.16□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W YHR202WP38887 602 aa4.16□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W PMT6P42934 759 aa4.16□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W YJR096WP47137 282 aa4.16□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W ASN1P49089 572 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W HFD1Q04458 532 aa4.16□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W ULA1Q12059 462 aa4.16□□□□□ -1.74
NSE4YDL105W TPK2P06245 380 aa4.15□□□□□ -1.75
NSE4YDL105W COS111P38308 924 aa4.15□□□□□ -1.75
NSE4YDL105W RET2P43621 546 aa4.15□□□□□ -1.75
NSE4YDL105W DIP5P53388 608 aa4.15□□□□□ -1.75
NSE4YDL105W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
NSE4YDL105W MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
NSE4YDL105W VHS3Q08438 674 aa4.15□□□□□ -1.75
NSE4YDL105W NUP1P20676 1076 aa4.14□□□□□ -1.75
NSE4YDL105W UBP12P39538 1254 aa4.14□□□□□ -1.75
NSE4YDL105W GZF3P42944 551 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
NSE4YDL105W BIT61P47041 543 aa4.14□□□□□ -1.75
NSE4YDL105W YGR153WP48238 217 aa4.14□□□□□ -1.75
NSE4YDL105W UFO1Q04511 668 aa4.14□□□□□ -1.75
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