RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589254.1

USP36-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 3

Gene USP36, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-215ENST00000589254 MBIPQ9NS73 344 aa14.65□□□□□ -0.06
USP36-215ENST00000589254 JAG2Q9Y219 1238 aa14.65□□□□□ -0.06
USP36-215ENST00000589254 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.65□□□□□ -0.06
USP36-215ENST00000589254 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 F8W031 263 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 IGKV5-2P06315 115 aa14.64□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 GOLGA2Q08379 1002 aa14.64□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.64□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 SHISA4Q96DD7 197 aa14.64□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 COA1Q9GZY4 146 aa14.64□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 HOXB7P09629 217 aa14.63□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.63□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.63□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 ELP3Q9H9T3 547 aa14.63□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.63□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 DLL1O00548 723 aa14.62□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 INHBEP58166 350 aa14.62□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.62□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.62□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.62□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 DLGAP5Q15398 846 aa14.61□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.61□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 CFAP100Q494V2 611 aa14.61□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.61□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.61□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 OPTNQ96CV9 577 aa14.61□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.61□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 VEZTQ9HBM0 779 aa14.61□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 CTGFP29279 349 aa14.6□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 MTFR1Q15390 333 aa14.6□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.6□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 CD209Q9NNX6 404 aa14.6□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.6□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 ALPK3Q96L96 1907 aa14.6□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 ZNF853P0CG23 659 aa14.59□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 PRO3102Q9H379 93 aa14.59□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 ADAMTS8Q9UP79 889 aa14.59□□□□□ -0.07
USP36-215ENST00000589254 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.58□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 TAF5LO75529 589 aa14.58□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 SPDYE6P0CI01 402 aa14.58□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 RASA3Q14644 834 aa14.58□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.58□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.58□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 A0A0C4DFX4 3053 aa14.58□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.57□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 CHRNDQ07001 517 aa14.57□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 CCL15Q16663 113 aa14.57□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 G2E3Q7L622 706 aa14.57□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 TSPYL6Q8N831 410 aa14.57□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 TEPSINQ96N21 525 aa14.57□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 LAMA3Q16787 3333 aa14.57□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.56□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 ITGA6P23229 1130 aa14.56□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.56□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.56□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.56□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.56□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.56□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.55□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.55□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 CASP7P55210 303 aa14.55□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 VGLL4Q14135 290 aa14.55□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 GRIK5Q16478 980 aa14.55□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 RUNDC1Q96C34 613 aa14.55□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 LRCH3Q96II8 777 aa14.55□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 H7C1W4 665 aa14.54□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.54□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.54□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.54□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 DPF3Q92784 378 aa14.54□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.54□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.54□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 MGAMO43451 1857 aa14.53□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 KSR2Q6VAB6 950 aa14.53□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.53□□□□□ -0.08
USP36-215ENST00000589254 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.52□□□□□ -0.09
USP36-215ENST00000589254 BTBD19C9JJ37 291 aa14.52□□□□□ -0.09
USP36-215ENST00000589254 IL1R1P14778 569 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms