RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 MAP4K1Q92918 833 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 RPS6KA4O75676 772 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 KCNJ4P48050 445 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CREB3L3Q68CJ9 461 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 TMX3Q96JJ7 454 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 TAF1LQ8IZX4 1826 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CCDC66A2RUB6 948 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 TAF5LO75529 589 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 PDE8BO95263 885 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 MCM4P33991 863 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CUL4AQ13619 759 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 TTC14Q96N46 770 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 TM6SF1Q9BZW5 370 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 NARFQ9UHQ1 456 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 SLC27A2O14975 620 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 GNPATO15228 680 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 PHF14O94880 888 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 FAM193AP78312 1265 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 RNF20Q5VTR2 975 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 HMG20BQ9P0W2 317 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 C4BP0C0L5 1744 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 ZPR1O75312 459 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CHGBP05060 677 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 FGFR2P21802 821 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 PSMA5P28066 241 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 SSFA2P28290 1259 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 NUCB2P80303 420 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 SCARF1Q14162 830 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 ERFEQ4G0M1 354 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 TBC1D9BQ66K14 1250 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 SMIM5Q71RC9 77 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 LPIN2Q92539 896 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 MPHOSPH8Q99549 860 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 TRPC6Q9Y210 931 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-204ENST00000546621 CASZ1Q86V15 1759 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 SLC5A1P13866 664 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 MCAMP43121 646 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 ZAP70P43403 619 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 AK2P54819 239 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 VPS53Q5VIR6 699 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 RUFY3Q7L099 469 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 GBP4Q96PP9 640 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 NYXQ9GZU5 481 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 EFCC1Q9HA90 598 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 PDRG1Q9NUG6 133 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 AKAP11Q9UKA4 1901 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 C4AP0C0L4 1744 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 TRAK2O60296 914 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 CPA1P15085 419 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-204ENST00000546621 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms