RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524095.5

CLVS1-211, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLVS1, Length 709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-211ENST00000524095 NBPF11Q86T75 865 aa9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 COA1Q9GZY4 146 aa9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 SCN9AQ15858 1988 aa9.57□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 UNCXA6NJT0 531 aa9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 KLRK1P26718 216 aa9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 GTF2IP78347 998 aa9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 NEUROD2Q15784 382 aa9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 CERS5Q8N5B7 392 aa9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 CCDC191Q8NCU4 936 aa9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 MYD88Q99836 296 aa9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 PRO3102Q9H379 93 aa9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 AOX1Q06278 1338 aa9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 MYO3BQ8WXR4 1341 aa9.56□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.55□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 COL6A3P12111 3177 aa9.55□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 DLGAP5Q15398 846 aa9.55□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa9.55□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa9.55□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.55□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 SH3TC2Q8TF17 1288 aa9.55□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 GREM2Q9H772 168 aa9.55□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 LRRC37AA6NMS7 1700 aa9.55□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 LAMB4A4D0S4 1761 aa9.55□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 MED23Q9ULK4 1368 aa9.54□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 HOXB7P09629 217 aa9.54□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.54□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 DPF3Q92784 378 aa9.54□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa9.54□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 LEMD3Q9Y2U8 911 aa9.54□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 LAMB2P55268 1798 aa9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 CLRN2A0PK11 232 aa9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 SNAP23O00161 211 aa9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 CTSWP56202 376 aa9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 RASA3Q14644 834 aa9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 MTFR1Q15390 333 aa9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 OPTNQ96CV9 577 aa9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 ELP3Q9H9T3 547 aa9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 CD209Q9NNX6 404 aa9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-211ENST00000524095 SSC5DA1L4H1 1573 aa9.52□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 IGKV5-2P06315 115 aa9.52□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 GOLGA2Q08379 1002 aa9.52□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 LMOD3Q0VAK6 560 aa9.52□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 ARHGEF6Q15052 776 aa9.52□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 CFAP100Q494V2 611 aa9.52□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.52□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 SHISA4Q96DD7 197 aa9.52□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 F8W031 263 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF853P0CG23 659 aa9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 CTGFP29279 349 aa9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 MBIPQ9NS73 344 aa9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 IRS2Q9Y4H2 1338 aa9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.5□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 H7C1W4 665 aa9.5□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 TLR2O60603 784 aa9.5□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 GTF2A2P52657 109 aa9.5□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 MAP3K9P80192 1104 aa9.5□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 CCL15Q16663 113 aa9.5□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 TEPSINQ96N21 525 aa9.5□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.5□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 VEZTQ9HBM0 779 aa9.5□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa9.5□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 TAF5LO75529 589 aa9.49□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 CSF1RP07333 972 aa9.49□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 CHRNDQ07001 517 aa9.49□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.49□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 LRCH3Q96II8 777 aa9.49□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CLVS1-211ENST00000524095 LAMA3Q16787 3333 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms